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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003531`

染色体: Chr03 坐标: 53912837-53913574 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003531`
名称	SmilChr03G003531
描述	glutathione S-transferase T3-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	53912837 - 53913574 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018996`
GeneID	`131018996`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018996`
原始查询	`SmilChr03G003531`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutathione S-transferase T3-like
产物	glutathione S-transferase T3-like
Arabidopsis	`AT3G47680` (AT3G47680) DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823922] identity=28.3; qcov=0.404; evalue=1.34e-07; confidence=low
Rice	`Os12g0228500` - identity=24.1; qcov=0.763; evalue=6.2e-08; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018996

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803665.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803665.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803665.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803665.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803665.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:53912856`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B47,B63,C12,C57
`Chr3:53912865`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C45,C5,C52
`Chr3:53912866`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B34,C35
`Chr3:53912889`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr3:53912897`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,C55,C61,C68
`Chr3:53912900`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	16	A16,B110,B121,B131,B15,B29,B30,B6,B84,B87,B95,B98,C20,C42,C52,C71
`Chr3:53912995`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr3:53913003`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B117
`Chr3:53913003`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B117
`Chr3:53913007`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	A6,A9,B103,B11,B133,B42,B43,B64,B73,B80,B86,B90,C47,C60,C71
`Chr3:53913013`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B42,B43,B90
`Chr3:53913019`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A22,B111,B122,C56

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947682.1
ATGTATGCTTGGTGCTTTGTAAGTAACAATCCAATTGTTGGCACTAACCGAAATAGTAAGTCGTTTTGGAAAACTGTTGCAGATATGTATGAGCAAAGTCGAGCAGATAATCCAGAAATTGGAGGTCGAAGGAGCATCGAATCATTGAGGAACCGTTACAAACGCCTCAACAAAAATGTAACTCTGTGGGTTGCTGCATATAAGAAAGCATATGAGCGACGAGCGAGTGGTCAGTCTAAAGAGGATATCGAGATAGCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018996
ATGTATGCTTGGTGCTTTGTAAGTAACAATCCAATTGTTGGCACTAACCGAAATAGTAAGTCGTTTTGGAAAACTGTTGCAGATATGTATGAGCAAAGTCGAGCAGATAATCCAGAAATTGGAGGTCGAAGGAGCATCGAATCATTGAGGAACCGTTACAAACGCCTCAACAAAAATGTAACTCTGTGGGTTGCTGCATATAAGAAAGCATATGAGCGACGAGCGAGTGGTCAGTCTAAAGAGGATATCGAGATAGCAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803665.1
MYAWCFVSNNPIVGTNRNSKSFWKTVADMYEQSRADNPEIGGRRSIESLRNRYKRLNKNVTLWVAAYKKAYERRASGQSKEDIEIAAQAIYGKPKFTHHDVFEKVMSSYPNWELKLDSTGYVRRSHPDDEDSVDESRSSSKKSRTDEDVDPPTDSTPETPGSDASKFHRPIGRDKAKVKAKRKGKQTESQSSIVSDAFTAELREMRITREKEMKTSTLNTLMKKNQLSPDEEALKRRLMAELYGM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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