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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003536`

染色体: Chr03 坐标: 53964684-53974120 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003536`
名称	SmilChr03G003536
描述	mitochondrial intermediate peptidase, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	53964684 - 53974120 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014419`
GeneID	`131014419`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014419`
原始查询	`SmilChr03G003536`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitochondrial intermediate peptidase, mitochondrial
产物	mitochondrial intermediate peptidase%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT5G51540` (AT5G51540) Zincin-like metalloproteases family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835228] identity=64.8; qcov=0.956; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0686500` - identity=60.8; qcov=0.956; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004222 (metalloendopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis); GO:0006518 (peptide metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF01432 (Peptidase_M3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014419

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057798374.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057798374.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798374.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798374.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798374.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:53964850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr3:53965083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,C27
`Chr3:53965095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B99
`Chr3:53966113`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,C80
`Chr3:53966346`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:53966357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr3:53966368`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr3:53968052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr3:53972133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B136,B46,B82
`Chr3:53972326`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr3:53972888`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B79,C45,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798374.1

716 aa

358

716

Peptidase_M3

PF01432 Peptidase_M3 260-691 aa

XP_057798375.1

707 aa

354

707

Peptidase_M3

PF01432 Peptidase_M3 251-682 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798374.1`	Pfam	`PF01432`	Peptidase_M3	Family	260	691	3.9e-110	370.1	Peptidase family M3
`XP_057798375.1`	Pfam	`PF01432`	Peptidase_M3	Family	251	682	3.7e-110	370.1	Peptidase family M3

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009098200.1
GGAAATACAACAGTGAAAAAAATATTAGTTGACATATAATTTGGGTCTTTAAGCCTCTACTATTCACTCTCCGCTGCAATATCCGGCTGCGATATCCGTCTTATTCATCTGAGATCAGTCTCTCTCCCGCCACCGCTATGCTGCGCGCCCTAAGCCGCACGCCTGCGGTGTATTTTAGACACGACCGCCGGTTTCAACATTCCGCTACCGCTCCGCTAGTCAAAGAAGCCGGACTCTATGGATTCGACCACTTGAAAACT...

XM_057942391.1
GGAAATACAACAGTGAAAAAAATATTAGTTGACATATAATTTGGGTCTTTAAGCCTCTACTATTCACTCTCCGCTGCAATATCCGGCTGCGATATCCGTCTTATTCATCTGAGATCAGTCTCTCTCCCGCCACCGCTATGCTGCGCGCCCTAAGCCGCACGCCTGCGGTGTATTTTAGACACGACCGCCGGTTTCAACATTCCGCTACCGCTCCGCTAGTCAAAGAAGCCGGACTCTATGGATTCGACCACTTGAAAACT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131014419
ATGCTGCGCGCCCTAAGCCGCACGCCTGCGGTGTATTTTAGACACGACCGCCGGTTTCAACATTCCGCTACCGCTCCGCTAGTCAAAGAAGCCGGACTCTATGGATTCGACCACTTGAAAACTGCCAAAGGATTCCAACGCATGGTCGACGACGCGGTTGAACGGTCTAATGAACTTGTTAATTATATTGCTGGAATGCCTTCAGCTCCTGAAATTATCAAAGCCATGGATGAAATATCTGATGCGGCTTATGAACATTG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057798374.1
MLRALSRTPAVYFRHDRRFQHSATAPLVKEAGLYGFDHLKTAKGFQRMVDDAVERSNELVNYIAGMPSAPEIIKAMDEISDAAYEHCTVLEVCTVIDSAELCRHTHPDREFVQEASKASLRLNEYLHYLNSNPSLYNAIIRAEQNQHLLTDEALRAARHLRTDLEKGGIHLSPEKLDRVNQLNIDILQLCREFNENIIADPGHVDIFPASRIPKQLHHLTKAIYRPSSFAPKTSVGIGPNMKEKGLRLTTEPNCLCSILQ...

XP_057798375.1
MLRALSRTPAVYFRHDRRFQHSATAPLVKEAGLYGFDHLKTAKGFQRMVDDAVERSNELVNYIAGMPSAPEIIKAMDEISDAVCTVIDSAELCRHTHPDREFVQEASKASLRLNEYLHYLNSNPSLYNAIIRAEQNQHLLTDEALRAARHLRTDLEKGGIHLSPEKLDRVNQLNIDILQLCREFNENIIADPGHVDIFPASRIPKQLHHLTKAIYRPSSFAPKTSVGIGPNMKEKGLRLTTEPNCLCSILQLASDTEVRK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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