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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003541`

染色体: Chr03 坐标: 54036033-54038069 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003541`
名称	SmilChr03G003541
描述	protein LPA2
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	54036033 - 54038069 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014424`
GeneID	`131014424`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014424`
原始查询	`SmilChr03G003541`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein LPA2
产物	protein LPA2
Arabidopsis	`AT5G51545` (LPA2) low psii accumulation2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3771487] identity=47.1; qcov=1.02; evalue=7.56e-45; confidence=medium
Rice	`Os02g0125000` (P0575F10.35-1) - identity=74.3; qcov=0.368; evalue=3.81e-31; confidence=low
GO	GO:0009507 (chloroplast)
KEGG	-
Pfam	PF27949 (LPA2-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014424

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057798388.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057798388.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057798388.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798388.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798388.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:54036231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,C50
`Chr3:54036232`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr3:54036279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr3:54036387`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr3:54036410`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798388.1

190 aa

190

LPA2-like

PF27949 LPA2-like 60-186 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798388.1`	Pfam	`PF27949`	LPA2-like	Family	60	186	2.4e-54	183.7	Protein LOW PSII ACCUMULATION 2 like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942405.1
AAGTAGTCAAGGTGAGGTGTTTCAACTCACAAGTGAAGCTTTACATAAGAGCAAGAGAGTGAAACTAACTAAACTGAAAATGGCGCTAATAGTGCACCCGACAGCAACAGCATCATCATCATCATCTTTTACTACCAACAAACCCCGTCTTCTCCTCCACACACCATCCCACGCCAAATTTCGCATCAAATTCCAGCAGGATTCTTCCGCTGAAGAAACCCCTTCGACCCCATCTACCAAGAAACCCGGTAATCCGTCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014424
ATGGCGCTAATAGTGCACCCGACAGCAACAGCATCATCATCATCATCTTTTACTACCAACAAACCCCGTCTTCTCCTCCACACACCATCCCACGCCAAATTTCGCATCAAATTCCAGCAGGATTCTTCCGCTGAAGAAACCCCTTCGACCCCATCTACCAAGAAACCCGGTAATCCGTCGCCAGGTTCGGGCTTCGGCGCCTCGGCTGCAGCTTCGACAGCGGCTCCGGCCAAGAAGAAGCAGTCGAAAGGGAAGAAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798388.1
MALIVHPTATASSSSSFTTNKPRLLLHTPSHAKFRIKFQQDSSAEETPSTPSTKKPGNPSPGSGFGASAAASTAAPAKKKQSKGKKERASIIRREPVEKPSFVTAQEAARAEELSKNESAFLLAWSGLGAIILIEGIALAASGFLPEAWDNFLVKYLYPSFTPTVFLFVAGTVIYGVSKYLQNENSEGGN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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