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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003554`

染色体: Chr03 坐标: 54183801-54185205 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003554`
名称	SmilChr03G003554
描述	uncharacterized SmilChr03G003554
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	54183801 - 54185205 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019001`
GeneID	`131019001`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019001`
原始查询	`SmilChr03G003554`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G25270` (AT3G25270) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121] identity=26.9; qcov=0.662; evalue=1.6e-08; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=28.3; qcov=0.681; evalue=3.77e-12; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019001

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057803670.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057803670.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057803670.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803670.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803670.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:54183854`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr3:54183882`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B23,B80,C15,C19
`Chr3:54183884`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	18	A1,A25,B11,B117,B131,B42,B56,B57,B58,B78,B9,C13,C23,C29,C54,C57,C86,D8
`Chr3:54183888`	`A`	`ACC`	2bp_insertion	frameshift_variant	18	A1,A25,B11,B117,B131,B42,B56,B57,B58,B78,B9,C13,C23,C29,C54,C57,C86,D8
`Chr3:54183919`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C17,C28,C73
`Chr3:54183929`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C16
`Chr3:54183929`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr3:54183935`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	31	A21,B100,B102,B103,B115,B126,B128,B130,B24,B30,B33,B35,B42,B43,B57,B60,B66,B73,B78,B80,C16,C18,C3,C31,C35,C45,C49,C52,C53,C86,D2
`Chr3:54183946`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B4,B51,B97
`Chr3:54183946`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B4,B51,B97
`Chr3:54184774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A10,B125,B17,B21
`Chr3:54184774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B125,B17,B21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803670.1

213 aa

106

213

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 12-82 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803670.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	12	82	8e-15	56.0	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947687.1
ATGCCACATGTTTGGCAGAGCAGCTTGTTCAATAAAAGAGCAGCGAAAGTTTGGCAGATCTGCGCCCCTCAAAAAGTTAAGGTTACGGCATGGAGAATTTTTCGGAATAGGCTGCCTACCTGTGACAATTTGAGCAAGAGAAACATTTCGCTAGATGATGTGGAAATCATGTGCAATGCTTGCTGCCAGGAAAAAGAGTCGGCGGACCACCTGTTTCGCTCCTGTCCGAAGACAGAAATGATTTGGAACGAGGTACAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019001
ATGCCACATGTTTGGCAGAGCAGCTTGTTCAATAAAAGAGCAGCGAAAGTTTGGCAGATCTGCGCCCCTCAAAAAGTTAAGGTTACGGCATGGAGAATTTTTCGGAATAGGCTGCCTACCTGTGACAATTTGAGCAAGAGAAACATTTCGCTAGATGATGTGGAAATCATGTGCAATGCTTGCTGCCAGGAAAAAGAGTCGGCGGACCACCTGTTTCGCTCCTGTCCGAAGACAGAAATGATTTGGAACGAGGTACAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803670.1
MPHVWQSSLFNKRAAKVWQICAPQKVKVTAWRIFRNRLPTCDNLSKRNISLDDVEIMCNACCQEKESADHLFRSCPKTEMIWNEVQKWTRLYTARSDCNEAHFHSFIHKGRGKNIKKFLEALWTCTTWLIWKGRNESRFQNKNWEVQKMLGKIKASQIHVFLVIIPAEFQPRGPSYVQPWTPSFNTLKLRMRNERELRAAGARLRVGQAEGSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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