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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003555`

染色体: Chr03 坐标: 54197475-54201540 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003555`
名称	SmilChr03G003555
描述	uncharacterized SmilChr03G003555
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	54197475 - 54201540 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014437`
GeneID	`131014437`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014437`
原始查询	`SmilChr03G003555`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837793]; symbol=AT1G12380; hit=AT1G12380; species=arabidopsis; confidence=high
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837793]; symbol=AT1G12380; hit=AT1G12380; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G12380` (AT1G12380) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837793] identity=55.5; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0261400` - identity=49.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF25908 (DUF7963)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014437

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798400.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057798400.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798400.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798400.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798400.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:54199066`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B117
`Chr3:54199066`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B117
`Chr3:54199124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B125,B128,C73
`Chr3:54199304`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B19
`Chr3:54199423`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr3:54199477`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B19
`Chr3:54199794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr3:54200003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr3:54200048`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:54200246`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:54200629`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:54201004`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798400.1

747 aa

374

747

DUF7963

PF25908 DUF7963 7-91 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798400.1`	Pfam	`PF25908`	DUF7963	Domain	7	91	2e-44	150.3	Domain of unknown function (DUF7963)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009098208.1
ACAGATACCCACTCCACCATTTCCACTTCTTCCACACACACACACTCTCTCTCTCTCTATATGTTTCTGTCACTGCTCTGCCATCTCTCTCTTTCCTGGATACCGTATCTTCTCTGGCCTCCCTTCCTTCACCTTGTCTCACTCTAACTATTTCCGTACACGCTTTCCTCTCCGGCTAAATGCCGGCCGCCGCCGCCAGCCTCAACCCCACTTCAATCTCTTCCTAAATGAACTAATCCTTCTAACGTCAAGATGCTTCC...

XM_057942417.1
ACCCACTCCACCATTTCCACTTCTTCCACACACACACACTCTCTCTCTCTCTATATGTTTCTGTCACTGCTCTGCCATCTCTCTCTTTCCTGGATACCGTATCTTCTCTGGCCTCCCTTCCTTCACCTTGTCTCACTCTAACTATTTCCGTACACGCTTTCCTCTCCGGCTAAATGCCGGCCGCCGCCGCCAGCCTCAACCCCACTTCAATCTCTTCCTAAATGAACTAATCCTTCTAACGTCAAGATGCTTCCAACTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014437
ATGTCTAATGCTTCAACCTCAACCGAAGACGCGGCGGCGAAGGCGGCGAGCAAGCGCTATGAAGGTCTGGTGGCGGTCCGTAGCAAGGCGGTGCAAGGGAAAGGAGCTTGGTACTGGGCTCATCTCGAGCCAATTTTGATCAGGGAAAATGAAACGAAATCGCCCAAAGCCGTGAAGCTGAAATGCACTCTCTGCGATGCCGCCTTCTCTGCATCAAACCCATCAAGAACTGCTACTGAACACCTCAAGAAAGGGACTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798400.1
MSNASTSTEDAAAKAASKRYEGLVAVRSKAVQGKGAWYWAHLEPILIRENETKSPKAVKLKCTLCDAAFSASNPSRTATEHLKKGTCPNFSSMLNPLTQLPPLASPSSRKNNRKRCLQSQQSNDASLDVCPLNMVDPSRFLSNEVSFLPAQAPPPLCLKPLLLSGGREDYGPLARLESSVKKLKSPSGSPISALSKNQVKKAFDVLADWFYESCGVVSLSSLEHPKFRAFLNQVGFPASLKMEFLSSRLESKFEGARMES...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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