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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003559`

染色体: Chr03 坐标: 54242119-54246327 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003559`
名称	SmilChr03G003559
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP53
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	54242119 - 54246327 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014440`
GeneID	`131014440`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014440`
原始查询	`SmilChr03G003559`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP53
产物	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP53
Arabidopsis	`AT4G25340` (FKBP53) FK506 BINDING PROTEIN 53 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828637] identity=46.9; qcov=1.03; evalue=6.55e-119; confidence=high
Rice	`Os04g0446500` (OsFKBP58) - identity=39.2; qcov=1.12; evalue=4.41e-88; confidence=medium
GO	GO:0003755 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00254 (FKBP_C); PF17800 (NPL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014440

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798401.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057798401.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057798401.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798401.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798401.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:54242662`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:54242727`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr3:54244201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:54244564`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr3:54244567`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr3:54244729`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B4,B51,B74,B97
`Chr3:54245199`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr3:54245836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr3:54245837`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr3:54245861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr3:54246038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798401.1

493 aa

246

493

NPL

FKBP_C

PF17800 NPL 3-93 aa PF00254 FKBP_C 400-490 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798401.1`	Pfam	`PF17800`	NPL	Domain	3	93	2.2e-24	86.7	Nucleoplasmin-like domain
`XP_057798401.1`	Pfam	`PF00254`	FKBP_C	Domain	400	490	1.4e-33	115.8	FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009098212.1
CATTTTATTGCTTTTCAACAGAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAATTCCGTGTTAGGGTTTAAGAGCGCTGTGAACACACTTTTTTGCCCTCTTGAGGTTTTACACAATACCGCAACCGGCATTTGAATTGAGCCACAGCAATGGCTTTCTGGGGGATTGAAGTAAAACCAGGCAAACCGTACATTTTGTCTGACGAGGAGAAAGGAAGGCTTCATGTAACTCAGGCGACATTAGGTTCGGGGTCATCGACTAAGAAGAGCAT...

XR_009098215.1
CATTTTATTGCTTTTCAACAGAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAATTCCGTGTTAGGGTTTAAGAGCGCTGTGAACACACTTTTTTGCCCTCTTGAGGTTTTACACAATACCGCAACCGGCATTTGAATTGAGCCACAGCAATGGCTTTCTGGGGGATTGAAGTAAAACCAGGCAAACCGTACATTTTGTCTGACGAGGAGAAAGGAAGGCTTCATGTAACTCAGGCGACATTAGGTTCGGGGTCATCGACTAAGAAGAGCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014440
ATGGCTTTCTGGGGGATTGAAGTAAAACCAGGCAAACCGTACATTTTGTCTGACGAGGAGAAAGGAAGGCTTCATGTAACTCAGGCGACATTAGGTTCGGGGTCATCGACTAAGAAGAGCATATTACAGTGTGAAGTGGGAGATAAAAAGCCGATATACCTGTGCTCCTTGTTGCCTGATAGACTCGAGACATGCCCATTAAACCTTGAGTTCGAGGAAGACGAAAAAGTCACCTTCTCTATCATTGGCCCTCAGAGTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798401.1
MAFWGIEVKPGKPYILSDEEKGRLHVTQATLGSGSSTKKSILQCEVGDKKPIYLCSLLPDRLETCPLNLEFEEDEKVTFSIIGPQSVHLSGFFYGDESDDEDDEDDYGCGLYEDDAMGIGSEDEEDADYDSEDEEDDEDLSEDDLCCGYPHSPVPNSGVKIEEIVDDGKPTNENGMSKRVKKKKTDGNENSNSQIVPKAGTSVPVLESEDEDGFPVPAHDKKSEANLEKTKQESSGKKSQNKSEKTDAASGRNLKRKSGA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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