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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003563`

染色体: Chr03 坐标: 54270485-54272974 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003563`
名称	SmilChr03G003563
描述	putative pectinesterase/pectinesterase inhibitor 24
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	54270485 - 54272974 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014444`
GeneID	`131014444`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014444`
原始查询	`SmilChr03G003563`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative pectinesterase/pectinesterase inhibitor 24
产物	putative pectinesterase/pectinesterase inhibitor 24
Arabidopsis	`AT3G10710` (RHS12) root hair specific 12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820240] identity=52.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0788400` (OsPME6) - identity=43.5; qcov=0.89; evalue=2.34e-131; confidence=medium
GO	GO:0030599 (pectinesterase activity); GO:0042545 (cell wall modification); GO:0046910 (pectinesterase inhibitor activity)
KEGG	-
Pfam	PF01095 (Pectinesterase); PF04043 (PMEI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014444

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.80000	`XP_057798405.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057798405.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798405.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798405.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798405.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:54270673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:54270820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B42,B43,B44,B82
`Chr3:54270839`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A11,C33,C61
`Chr3:54270839`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A11,C33,C61
`Chr3:54270943`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C17
`Chr3:54270943`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C17
`Chr3:54270959`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A10,C29,C65,C66,C74
`Chr3:54270959`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A10,C29,C65,C66,C74
`Chr3:54271169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,D2
`Chr3:54271274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr3:54271300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr3:54271995`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798405.1

566 aa

283

566

PMEI

Pectinesterase

PF04043 PMEI 67-214 aa PF01095 Pectinesterase 259-550 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798405.1`	Pfam	`PF04043`	PMEI	Domain	67	214	2.8e-28	99.7	Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor
`XP_057798405.1`	Pfam	`PF01095`	Pectinesterase	Repeat	259	550	4.8e-141	469.5	Pectinesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942422.1
TCGCAAAGTATATATACACAGCAGCTTCACCCATATTTATAACAAATAAAAAAAACCAATTAAGCATGGCGAGCGTCAACCCCTACGGCAAGCTGAACGAGGCCGAGCAAGAAAGGCTGGTGGCGCGTATGAAAACGCGCAGACGCATCACCATCATCGCCGTATCCAGCATAGTCCTCGTGGCGGTCGTGGTGGCCGCCGCCGTCGGAGCCACTCAAACCCGAGACAACAACAAATCCGGCAGCGGCAGCGGCGTCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014444
ATGGCGAGCGTCAACCCCTACGGCAAGCTGAACGAGGCCGAGCAAGAAAGGCTGGTGGCGCGTATGAAAACGCGCAGACGCATCACCATCATCGCCGTATCCAGCATAGTCCTCGTGGCGGTCGTGGTGGCCGCCGCCGTCGGAGCCACTCAAACCCGAGACAACAACAAATCCGGCAGCGGCAGCGGCGTCTCCTCCTCCCTCAAGGCCTCCTGCGCCGCCACGCTGTACCCGGACTCCTGCTACACCAGCCTCGCCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798405.1
MASVNPYGKLNEAEQERLVARMKTRRRITIIAVSSIVLVAVVVAAAVGATQTRDNNKSGSGSGVSSSLKASCAATLYPDSCYTSLAPLVKSRNVGPQDLCKLSLQVSIDELSKASNHFLQDVVKKLNITDGRALAAIDSCRELCFLALDHLNDSISVGGATVFEAVHDLRTWLSSAGTYQQTCIDGLSEADAALSSLAEDHFRNSTEYTSNSLAFVSAIEESVGALGSVGRRRLMSSSQWLSFGERRLLQTASAKIKADA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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