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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003577`

染色体: Chr03 坐标: 54379225-54383030 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003577`
名称	SmilChr03G003577
描述	probable aminotransferase ACS12
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	54379225 - 54383030 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014458`
GeneID	`131014458`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014458`
原始查询	`SmilChr03G003577`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable aminotransferase ACS12
产物	probable aminotransferase ACS12
Arabidopsis	`AT5G51690` (ACS12) 1-amino-cyclopropane-1-carboxylate synthase 12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835243] identity=61.5; qcov=0.968; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0130400` (SSG6) - identity=60; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004069 (L-aspartate:2-oxoglutarate transaminase activity); GO:0006520 (amino acid metabolic process); GO:0008793 (aromatic-amino-acid:2-oxoglutarate transaminase activity); GO:0009058 (biosynthetic process); GO:0030170 (pyridoxal phosphate binding)
KEGG	-
Pfam	PF00155 (Aminotran_1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014458

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	0.60000	`XP_057798417.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057798417.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057798417.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798417.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798417.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:54379333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr3:54379422`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,B53,B57
`Chr3:54380142`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr3:54380404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr3:54382290`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,D11
`Chr3:54382429`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B91
`Chr3:54382429`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B91
`Chr3:54382538`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr3:54382710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798417.1

526 aa

263

526

Aminotran_1_2

PF00155 Aminotran_1_2 135-515 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798417.1`	Pfam	`PF00155`	Aminotran_1_2	Domain	135	515	8.5e-84	282.5	Aminotransferase class I and II

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942434.1
GATAAATTGAAGTGCGGAGAGGGCTTTGATGTCTTCTCACAAAACAAACCCCTGGCGAAAGATTCCAAACAGAATCCCATCTTTGCCTCTTTACCCAAGCAAATCACCACCTCAAACTTCACGAAACTACACACACAACACACACTCACTCTCCCCCAATCTCCACCGCCGTCGCTGCGGCACCCTCCGCCGCCTCACATGATCCAAACCCCGCCCAAGGAATCGACCCGCCGCCCAACCCGTACCGGCATGAGGCTTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014458
ATGATCCAAACCCCGCCCAAGGAATCGACCCGCCGCCCAACCCGTACCGGCATGAGGCTTATCGTACCGCTGCAAGGAGTGGTTCAAGGCCGCGGCGGCATACTCCTCGGCTCCCTGATTCCCTGCGCGCTCTTCTACTTCCTCCAATTTTACCTGAAGAGGAACCGCTCGCCTCCGCCACCGAACCCTCCGTCGCGCTCGACGTCGTCGGCGAACCTCTCCGAGCTGCCGCGCTCGTCGTCCCGCCCCAATTTGCTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798417.1
MIQTPPKESTRRPTRTGMRLIVPLQGVVQGRGGILLGSLIPCALFYFLQFYLKRNRSPPPPNPPSRSTSSANLSELPRSSSRPNLLSRGASMGRVQLSGRANNVAKPDESPYYIGLDRVREDAYDEVSNPDGVMQLGLSENRLSLDLIEERLSKNLTDLMSGAGGGGGGGALGMRGIATYQPMDGLLEFKMAMADFMTEAMGNTVSFDPSRMVLTSGATPALEILSFCLADPGNAFLVPAPYYPGFDRDMKWRTGVELIP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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