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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003596`

染色体: Chr03 坐标: 54599287-54601218 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003596`
名称	SmilChr03G003596
描述	uncharacterized SmilChr03G003596
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	54599287 - 54601218 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014474`
GeneID	`131014474`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014474`
原始查询	`SmilChr03G003596`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=28.8; qcov=0.358; evalue=1.34e-12; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=28.6; qcov=0.379; evalue=3.73e-15; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03108 (DBD_Tnp_Mut)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014474

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798451.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798451.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798451.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798451.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057798451.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:54599645`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr3:54599656`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A21,B24,B35,B83,C32,C68
`Chr3:54600112`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,B75,C15
`Chr3:54600119`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	151	A10,A14,A20,A21,A24,A5,A8,A9,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B106,B107,B108,B11,B111,B114,B117,B118,B119,B12,B121,B125,B126,B128,B13,B130,B131,B133,B136,B138,B139,B14,B15,B16,B17,B2,B20,B22,B23,B25,B27,B29,B3,B31,B32,B33,B34,B37,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B47,B48,B49,B5,B50,B52,B53,B56,B57,B58,B59,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B71,B75,B76,B78,B80,B82,B85,B87,B88,B89,B90,B92,B93,B94,B96,B97,B98,B99,C10,C12,C2,C20,C21,C22,C25,C27,C28,C29,C3,C32,C33,C34,C38,C39,C40,C41,C44,C46,C48,C49,C50,C51,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C6,C60,C61,C62,C64,C65,C66,C67,C68,C7,C77,C81,C83,C84,C87,D1,D10,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr3:54600121`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	151	A10,A14,A20,A21,A24,A5,A8,A9,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B106,B107,B108,B11,B111,B114,B117,B118,B119,B12,B121,B125,B126,B128,B13,B130,B131,B133,B136,B138,B139,B14,B15,B16,B17,B2,B20,B22,B23,B25,B27,B29,B3,B31,B32,B33,B34,B37,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B47,B48,B49,B5,B50,B52,B53,B56,B57,B58,B59,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B71,B75,B76,B78,B80,B82,B85,B87,B88,B89,B90,B92,B93,B94,B96,B97,B98,B99,C10,C12,C2,C20,C21,C22,C25,C27,C28,C29,C3,C32,C33,C34,C38,C39,C40,C41,C44,C46,C48,C49,C50,C51,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C6,C60,C61,C62,C64,C65,C66,C67,C68,C7,C77,C81,C83,C84,C87,D1,D10,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr3:54600181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A10,B10,B107,B131,B133,B23,B3,B33,B40,C39,C7,D2
`Chr3:54600202`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr3:54600279`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	A2,B110,B113,B115,B137,B94,C14,C20,C25,C3,C37,C4,C5,C65
`Chr3:54600305`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	78	A10,A11,A14,A15,A19,B1,B106,B109,B111,B119,B12,B123,B129,B133,B137,B138,B139,B15,B17,B2,B25,B27,B3,B30,B37,B4,B40,B44,B45,B47,B5,B60,B64,B65,B67,B69,B71,B81,B83,B84,B88,B9,B91,B93,B99,C1,C12,C15,C16,C17,C19,C22,C27,C33,C34,C36,C41,C42,C46,C52,C53,C54,C56,C59,C6,C64,C65,C66,C71,C77,C83,C84,C86,C87,C9,D1,D11,D5
`Chr3:54600350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,D9
`Chr3:54600356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr3:54600398`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C9,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798451.1

388 aa

194

388

DBD_Tnp_Mut

PF03108 DBD_Tnp_Mut 245-307 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798451.1`	Pfam	`PF03108`	DBD_Tnp_Mut	Family	245	307	3.3e-15	56.2	MuDR family transposase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942468.1
TTTTTAGGACAGTAACTTAGGTCAATTTCAAAATTAGGACAATAAATTTCGGGCTTGTAAAAGTAGGACACTAATTATTAAGTATTGCACCCGCAGGACAATTCTGGGCCCATTATCAAATTTCGGGCTTAATCTAATGATGTGTTAATTCTCAAATTCCATGTCATTAAAAATAAGAGTGAATTTGCCACATAATCAACCCACCCATGATTCATCAACTTCCCCATTCCATAACTTACGTGAAATTGTTTCTCCAAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014474
ATGGTGAAAGTAAGAGAGAAGAGATATTTGCATCAACCTCCTCCCATGTACAAAATTGACAAAGGTTATCTATCAGTTAATATTCATTATGATGGTGCATTTGTTTCATCACCTAGTGCAAAATATGTTGGGGGTGATCGAATGATATTAGACTATGTTGTTGCTAAGCAATTGAGCTTACAATCTTTAAGGAATAGTGTTTCTGAGTGGTTGTTATGTGATGGAGACATAAGGTTGTTTATATTACAAGATAACATGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798451.1
MVKVREKRYLHQPPPMYKIDKGYLSVNIHYDGAFVSSPSAKYVGGDRMILDYVVAKQLSLQSLRNSVSEWLLCDGDIRLFILQDNMFRLMSSDVEVKEYCLGSLAKRQVDFYVEEDKNGSLNVGEDVTEIDVNLGSTFVSIDVEGSKDYDDRMVMANVDDRSKDFSDGDYNMVEDSDEQDDDDASFYQYVSKDLDFHEDESGGESDQEADVVHTNFDEYKDSDGELEAASNPVFNPEVIFEPDFELGMIFTSREQFRKAV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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