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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003597`

染色体: Chr03 坐标: 54602511-54604990 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003597`
名称	SmilChr03G003597
描述	3-ketoacyl-CoA synthase 6-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	54602511 - 54604990 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014475`
GeneID	`131014475`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014475`
原始查询	`SmilChr03G003597`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	3-ketoacyl-CoA synthase 6-like
产物	3-ketoacyl-CoA synthase 6-like
Arabidopsis	`AT1G68530` (KCS6) 3-ketoacyl-CoA synthase 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843182] identity=44; qcov=1; evalue=9.6e-148; confidence=medium
Rice	`Os03g0220100` (WSL4) - identity=42.7; qcov=1.01; evalue=1.1e-149; confidence=medium
GO	GO:0006633 (fatty acid biosynthetic process); GO:0016020 (membrane); GO:0016747 (acyltransferase activity, transferring groups other than amino-acyl groups)
KEGG	smil00062 (Fatty acid elongation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF08392 (FAE1_CUT1_RppA); PF08541 (ACP_syn_III_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014475

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057798452.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057798452.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798452.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798452.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798452.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:54602632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr3:54602659`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B9,C22,C25
`Chr3:54602659`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B9,C22,C25
`Chr3:54602666`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	39	A20,B100,B11,B115,B136,B137,B139,B140,B15,B17,B2,B20,B23,B29,B34,B36,B37,B54,B58,B59,B66,B68,B69,B77,B81,B86,B92,B94,C10,C12,C15,C29,C30,C45,C7,C85,D3,D8,D9
`Chr3:54602901`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr3:54603242`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr3:54604382`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B136,B67
`Chr3:54604481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B129,B50,C33
`Chr3:54604604`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A8,B47,B5,B57,B60,B73,C70
`Chr3:54604724`	`C`	`CT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	2	A8,B5
`Chr3:54604724`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A8,B5
`Chr3:54604730`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798452.1

468 aa

234

468

FAE1_CUT1_RppA

ACP_syn_III_C

PF08392 FAE1_CUT1_RppA 64-347 aa PF08541 ACP_syn_III_C 364-445 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798452.1`	Pfam	`PF08392`	FAE1_CUT1_RppA	Family	64	347	4.4e-104	348.6	FAE1/Type III polyketide synthase-like protein
`XP_057798452.1`	Pfam	`PF08541`	ACP_syn_III_C	Domain	364	445	5.1e-07	30.5	3-Oxoacyl-[acyl-carrier-protein (ACP)] synthase III C terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942469.1
TTCAAAAAAGCTACATCTACAATTAAAACACAGAGATGTCACCTTGAGCTTGCATCCTTTAAATTCTGAAATTCTTGCCACTTTCCGCTTACCGTACCCACCCACAATCCCTAAAGCATGGCCAAAATCAGGAACAACAAGATTCTACTAAACCACTTCTTCACAGAATCAATGAAGCTCCCAATTCTTGCACTCCTCTTCTCCTTGGAATCTGTATTCATCCTCCAGAAATGGGGGCCAATGTACCACACTCTCGCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014475
ATGGCCAAAATCAGGAACAACAAGATTCTACTAAACCACTTCTTCACAGAATCAATGAAGCTCCCAATTCTTGCACTCCTCTTCTCCTTGGAATCTGTATTCATCCTCCAGAAATGGGGGCCAATGTACCACACTCTCGCCGCCCTATCCTTGCTCGTTCTCGCCATCGCCAAACTCTACATCTCAACCCCTTCTCCGCTATACCTAGTCGACTTCTCATGCCTCAAGCCTCCAAACTTCTGCAGGGTGCCATTGGCAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798452.1
MAKIRNNKILLNHFFTESMKLPILALLFSLESVFILQKWGPMYHTLAALSLLVLAIAKLYISTPSPLYLVDFSCLKPPNFCRVPLATYIEHVKMLDFLDEESVSFMAKVLKQSGQGEQTYLPPAIHFIPPKSSHHEATEEVHMALFPVLEDLLAKTKTSPAEIDVLIVNCSGFCPAPSLSSIVVNRFGMREDVKSFSVSGMGCSGSALGIDMAHNILKTRGNCKAVILSTEILSTGWYPGRDNAMLVLNCVFRMGAAAIL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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