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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003602`

染色体: Chr03 坐标: 54660210-54662829 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003602`
名称	SmilChr03G003602
描述	receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g25390
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	54660210 - 54662829 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014478`
GeneID	`131014478`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014478`
原始查询	`SmilChr03G003602`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g25390
产物	receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g25390
Arabidopsis	`AT2G45590` (AT2G45590) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819167] identity=50.8; qcov=1.06; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0251700` - identity=45.5; qcov=0.942; evalue=8.56e-172; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014478

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057798455.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798455.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798455.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798455.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798455.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:54660516`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr3:54660518`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C47,C49
`Chr3:54660539`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B123,B87,C16,C3,D4
`Chr3:54660542`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C47,C49
`Chr3:54660545`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	34	A20,A22,A7,B100,B105,B112,B123,B131,B140,B15,B18,B26,B49,B50,B51,B52,B58,B64,B75,B87,B90,C15,C16,C17,C18,C26,C3,C34,C64,C7,C71,C81,C82,D4
`Chr3:54660548`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B50
`Chr3:54660551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,B80
`Chr3:54660553`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B104,C43,C81
`Chr3:54660569`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr3:54660576`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C56,D4
`Chr3:54660576`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C56,D4
`Chr3:54660580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,B80,B98,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798455.1

704 aa

352

704

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF00069 Pkinase 83-242 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 83-246 aa PF00069 Pkinase 559-671 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798455.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	83	242	3e-32	112.8	Protein kinase domain
`XP_057798455.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	83	246	5.1e-31	108.6	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057798455.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	559	671	3e-32	112.8	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942472.1
AAAAATTAGTAAAAAAATTGATCATTATACATTAATGCATGACATTAGAGACAATACTTAGTGTTGAATAAATCCAACGGCCAGAAGCGTATGTACAAGTGTTGGAGCAAAAAGGGGGAAGGAAAAGCTTCACAGTGAAGCAGAAATATAGATACAATTAAGGTGTCTCTATCTGTATTCTCTCAATCAACTGCTCCATTTTTGCTGCCCTCATCACTCTGTTATGAGTTGTACTCATTAAACTCCCCCGACACCGCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014478
ATGCCCTCCCGCCGCCTCCTCTCTCCTCCGGCGCCGGCCCACCACCCGACCAACCACATCCTGCCGCCCCTCGCCGGCGGATTGACGGCGGCTTTTTCGTGCCTCCTCCTCCTGGTCCTCTGCTTCCGCAGAATCAGCAAGAAACGCACCGCCCCTTCCGCCTCCGACACCGACTCCAAGAAACCCCCTCTGCGCCTCTCCTACTCCCTCCTCCGCCGCGCCACTTCCAATTTCTCCCCCTCCCTCCGCCTGGGCCAGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798455.1
MPSRRLLSPPAPAHHPTNHILPPLAGGLTAAFSCLLLLVLCFRRISKKRTAPSASDTDSKKPPLRLSYSLLRRATSNFSPSLRLGQGGFGSVYRAEFKPGYYFVKDSGFTLSHGAVKLMDSGSLQGEREFQNELLFSSKIDCKYVVSVVGFSSSPKKRRMLLVYELMESGSLQDCLFHKKSEELKNWDKRFMIALNIAKGLEYLHHYCDPPIIHGDIKPSNILLDASFNARIGDFGLARFKAEDNVIVEGEVKKEGNLGN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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