当前解析结果
SmilChr03G003610| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003610 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003610 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G003610 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 54724309 - 54725298 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131014487 |
|---|---|
| GeneID | 131014487 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131014487 |
| 原始查询 | SmilChr03G003610 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131014487 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057798462.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057798462.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057798462.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057798462.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057798462.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:54724911 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B136,B33,C45,C46 |
Chr3:54724957 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 4 | A19,A3,B130,C78 |
Chr3:54724957 |
AT |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 4 | A19,A3,B130,C78 |
Chr3:54724958 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 33 | A14,A15,A20,A24,A25,A9,B131,B16,B30,B4,B57,B59,B62,B63,B70,B73,B79,B8,B80,B81,C12,C17,C28,C36,C40,C47,C50,C57,C61,C69,C75,D1,D11 |
Chr3:54724961 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B5,B57 |
Chr3:54724972 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 8 | A1,B27,B78,C14,C38,C6,C7,C77 |
Chr3:54724975 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C33,C5,C65 |
Chr3:54724984 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B26,B4,B89,C47 |
Chr3:54725004 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B76,C40 |
Chr3:54725006 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B53,B65,C71 |
Chr3:54725008 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B131 |
Chr3:54725020 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B4,B89 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。