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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003618`

染色体: Chr03 坐标: 54844007-54848069 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003618`
名称	SmilChr03G003618
描述	glycosylinositol phosphorylceramide mannosyl transferase 1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	54844007 - 54848069 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014492`
GeneID	`131014492`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014492`
原始查询	`SmilChr03G003618`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycosylinositol phosphorylceramide mannosyl transferase 1-like
产物	glycosylinositol phosphorylceramide mannosyl transferase 1-like
Arabidopsis	`AT3G55830` (EPC1) Nucleotide-diphospho-sugar transferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824749] identity=56.6; qcov=0.911; evalue=4.33e-131; confidence=high
Rice	`Os06g0705000` - identity=61.5; qcov=0.736; evalue=4.45e-116; confidence=high
GO	GO:0006486 (GO:0006486); GO:0016020 (membrane); GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF09258 (Glyco_transf_64)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014492

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057798466.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057798466.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798466.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798466.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798466.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:54844221`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr3:54844262`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B22
`Chr3:54844267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B43,B44
`Chr3:54844285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C64
`Chr3:54844377`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr3:54844436`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr3:54845132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr3:54846386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B19,C2,C37,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798466.1

349 aa

174

349

Glyco_transf_64

PF09258 Glyco_transf_64 89-341 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798466.1`	Pfam	`PF09258`	Glyco_transf_64	Domain	89	341	1.1e-72	245.0	Glycosyl transferase family 64 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942483.1
GTTGTCTAAAAAAGAAGAAAAGGAAAGGAAAGTGTGGTGCCTCAACTCCGTCACGCGCCATACTGAACATAACACCCGCCGGATTCACTGCAGCCGTAGCGCCGGCCGCCGGAACGATTTTCCTGGTCACCGACCCTAAGCGATTCTGCGGCGTCCCGTTGAACGGACGCGTGAAGATGTCGACCCTCATCGCCATCCGAGATGCGTCGCAGAACGGCAACGGTGGCGATTACTCTCCCGCCAAGGCGAAAGCGTCGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014492
ATGTCGACCCTCATCGCCATCCGAGATGCGTCGCAGAACGGCAACGGTGGCGATTACTCTCCCGCCAAGGCGAAAGCGTCGAATCGCGGCGGCCGCTCGCCTCTTCTTCGCAGGCTTCGCCTGCTTCTTGGCAGCGCCAAGTACAAGCTCCTCCTTCTGTTATGCTTCTTCACTTCCCTCTGTTTCCTCAGCTCGAAGTTGTCGTCTTTTATGGGGTGGAACCCTCATTATGCTTCTTCCGTTTATTCACCCTCGAGGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798466.1
MSTLIAIRDASQNGNGGDYSPAKAKASNRGGRSPLLRRLRLLLGSAKYKLLLLLCFFTSLCFLSSKLSSFMGWNPHYASSVYSPSRGGYTVLINTWKRNSLLKQSVAHYASCQGTDAIHVVWSENDLPSSKLREYLMQVVRKKSQTVHKPNFRFDLNEEDNLNNRFKPIEDLRTDAIFSVDDDVIIPCRTLDFAFTVWQTAPLTMVGFVPRVHWLDGERSGQAHYEYGGWWSVWWTGTYSMVLSKAAFFHKKYLDLYTNK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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