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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003632`

染色体: Chr03 坐标: 54994822-54999049 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003632`
名称	SmilChr03G003632
描述	transcription factor bHLH126-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	54994822 - 54999049 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014504`
GeneID	`131014504`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014504`
原始查询	`SmilChr03G003632`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor bHLH126-like
产物	transcription factor bHLH126-like
Arabidopsis	`AT4G25410` (AT4G25410) basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828644] identity=38.5; qcov=0.615; evalue=5.15e-30; confidence=medium
Rice	`Os01g0952800` (OsIRO2) - identity=26.5; qcov=0.67; evalue=3.17e-08; confidence=low
GO	GO:0000977 (RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0046983 (protein dimerization activity); GO:0090575 (RNA polymerase II transcription regulator complex)
KEGG	-
Pfam	PF00010 (HLH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014504

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798479.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798479.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798479.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798479.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057798479.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:54994951`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B6,C34
`Chr3:54995019`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A7,B101,B104,B123,B26,B40,B41,B5,B60,B61,B68,B99,C19,C21,C4,C51
`Chr3:54995201`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B139,B71,C35,C68
`Chr3:54995506`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,D1
`Chr3:54995700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B129,B22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798479.1

270 aa

135

270

HLH

PF00010 HLH 97-148 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798479.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	97	148	2e-07	31.4	Helix-loop-helix DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942496.1
CTAGTATTACAAATGCTTTACATTTACAATTAAGTTATATGGGCGTGTGATATATATATTCATTATTCTTTTTACTTTTTCTCTCTCTGAGGCAAGACTTACTGTAGGTTCGATCGACAGCTGTTGCCTCTATGTATTTAAAAACACACTTGACTTGTTCATTCTCTCTAATCCTCAACACAAATCCATTAATTCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGTGGTAATTAAGTTAAAGTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014504
ATGTATTTAAAAACACACTTGACTTGTTCATTCTCTCTAATCCTCAACACAAATCCATTAATTCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGTGGTAATTAAGTTAAAGTCAAGAATGTTTCCTATTTCGAGTGATGGGGTATCTGAGGATCCTTCCATATTTTTGGAGCTAGAAGATCTGCTTGCCGATTGTCCCATTCCACAGGGCAATCAAAATACTGAGAAAAAGAGGCCCAGAAAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798479.1
MYLKTHLTCSFSLILNTNPLIPLSLSLSLSLSLSLFVVIKLKSRMFPISSDGVSEDPSIFLELEDLLADCPIPQGNQNTEKKRPRKFASTRSQDDSKKTAHKFIEKQRRHEMTALYASLRSLLPLQYVKGKRAVSDHMHQAVNYVNDMKMNIEQLQKRRDKLRNITTSAAAADDDDGDPNTTVNGHDCVKITLFRDGIEILITHSPNDNIFPLSKVLADLLDRQLNVVHCVSTTTSHSTFLQTIHIEVNDSTNIDLPELQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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