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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003644`

染色体: Chr03 坐标: 55117015-55119453 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003644`
名称	SmilChr03G003644
描述	uncharacterized SmilChr03G003644
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	55117015 - 55119453 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019018`
GeneID	`131019018`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019018`
原始查询	`SmilChr03G003644`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U3 small nucleolar ribonucleoprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836786]; symbol=AT5G66540; hit=AT5G66540; species=arabidopsis; confidence=low
产物	U3 small nucleolar ribonucleoprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836786]; symbol=AT5G66540; hit=AT5G66540; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G66540` (AT5G66540) U3 small nucleolar ribonucleoprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836786] identity=66.7; qcov=0.496; evalue=1.03e-11; confidence=low
Rice	`Os11g0137100` - identity=73.5; qcov=0.256; evalue=1.32e-10; confidence=weak
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005732 (sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex); GO:0006364 (rRNA processing); GO:0032040 (small-subunit processome); GO:0034457 (Mpp10 complex)
KEGG	-
Pfam	PF04006 (Mpp10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019018

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803689.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057803689.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803689.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803689.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803689.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:55119263`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B19,B9,C41,C50
`Chr3:55119340`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,C62,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803689.1

133 aa

133

Mpp10

PF04006 Mpp10 3-53 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803689.1`	Pfam	`PF04006`	Mpp10	Family	3	53	2.3e-11	43.9	Mpp10 protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947706.1
ATGCATGTGGCACCTCTGGCCGTGTCTGATGCAGCTATGCTAGCTCCTGAAGAAGTATTTTCTGGTAATGGTGACATCAAAGAAGAAACTGAGCTAACAAAGGCAGATAGAAAGAGGAGAAGGGCAAAGAAAAAAAGACAGTTTAAAGCTGAGTCTGTCGAACGGATGTCAGTAAAGACACAGCTAAGCACATTGAAGAAACCCGAAGATGGGCAGCTAAGCACAAAATGGATTGGACTGTTTGAAGTACAAACCCAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019018
ATGCATGTGGCACCTCTGGCCGTGTCTGATGCAGCTATGCTAGCTCCTGAAGAAGTATTTTCTGGTAATGGTGACATCAAAGAAGAAACTGAGCTAACAAAGGCAGATAGAAAGAGGAGAAGGGCAAAGAAAAAAAGACAGTTTAAAGCTGAGTCTGTCGAACGGATGTCAGTAAAGACACAGCTAAGCACATTGAAGAAACCCGAAGATGGGCAGCTAAGCACAAAATGGATTGGACTGTTTGAAGTACAAACCCAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803689.1
MHVAPLAVSDAAMLAPEEVFSGNGDIKEETELTKADRKRRRAKKKRQFKAESVERMSVKTQLSTLKKPEDGQLSTKWIGLFEVQTQFPNGTVEIKNAKSGKAFKVNGQRLKAYYGHEPRIREELDPSPDTNHP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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