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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003680`

染色体: Chr03 坐标: 55638716-55645540 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003680`
名称	SmilChr03G003680
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 63-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	55638716 - 55645540 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014548`
GeneID	`131014548`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014548`
原始查询	`SmilChr03G003680`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 63-like
产物	zinc finger CCCH domain-containing protein 63-like
Arabidopsis	`AT5G51980` (AT5G51980) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835273] identity=61.3; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0677700` (OsC3H17) - identity=54.2; qcov=0.793; evalue=2.43e-125; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40); PF00642 (zf-CCCH); PF18044 (zf-CCCH_4); PF18345 (zf_CCCH_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014548

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798535.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057798535.1`
3	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057798535.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057798535.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798535.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:55639188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr3:55640617`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,B57
`Chr3:55640903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B82,B93,C19,C34,C50
`Chr3:55641235`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr3:55643449`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr3:55644736`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B43
`Chr3:55644736`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B43
`Chr3:55644942`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B15
`Chr3:55644942`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B15
`Chr3:55645139`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	32	A1,A11,A24,B100,B109,B13,B137,B139,B15,B36,B38,B39,B41,B5,B54,B72,B83,B86,C10,C17,C18,C2,C30,C35,C42,C46,C5,C59,C60,C74,C75,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798535.1

435 aa

218

435

zf-CCCH

zf-CCCH_4

zf_CCCH_4

WD40

PF00642 zf-CCCH 113-133 aa PF18044 zf-CCCH_4 113-133 aa PF18345 zf_CCCH_4 115-133 aa PF00400 WD40 142-178 aa PF00400 WD40 264-299 aa PF00400 WD40 304-338 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798535.1`	Pfam	`PF00642`	zf-CCCH	Family	113	133	5.3e-06	26.9	Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type (and similar)
`XP_057798535.1`	Pfam	`PF18044`	zf-CCCH_4	Domain	113	133	2.5e-08	34.2	CCCH-type zinc finger
`XP_057798535.1`	Pfam	`PF18345`	zf_CCCH_4	Domain	115	133	2.2e-08	34.6	Zinc finger domain
`XP_057798535.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	142	178	5.9e-30	103.1	WD domain, G-beta repeat
`XP_057798535.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	264	299	5.9e-30	103.1	WD domain, G-beta repeat
`XP_057798535.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	304	338	5.9e-30	103.1	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942552.1
TGTTCGAATTTCCCCTCGCAAAAATAAATTTCCCCTTTTTAAGCATCAGCAAAATAATTGCACACATTTATATTAAAATGAAAAAAAAACAGAAAGGAAAGGCGTGTTTCTTCCTCCTCCTACTCTCGCCATAATTCCTTTTTCTCGAAAATCTTGAATTCCATACCCACTGCCAGCGTCCCGCAATCCCAAAATTAGGGTTCATAAAATTCCCTTCAAAACCCTAATCCTGAAATCAGATTCTCCCATTAGTGTCTTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014548
ATGGATGTGGATGGGGGAAGAAGGATTTTTAACCGCCTCGGACCGTCGTCTTCAAGTGATAACCTGAATAACAACAGTAGGCAGCAGAAGGTGTGTTTTCATTGGGAAAATGGAAAGTGCACGAGAAATCCGTGCCCCTTTTTGCACGCAGAGCTGCCGACGGCGGCGAATGGCAAGAGGGGGCACCAAGGTTTCGGGGCGGAGGATAATTACCGTGGCGGTGGCGGATTACGGAGGAGCGGGAACTATAATTTTAGTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798535.1
MDVDGGRRIFNRLGPSSSSDNLNNNSRQQKVCFHWENGKCTRNPCPFLHAELPTAANGKRGHQGFGAEDNYRGGGGLRRSGNYNFSNNNSWGRPQSQHPASGNRNFVRKVEKKICNYYVQGSCRYGENCKFLHQWSTDCFTLLTPLEGHKQAVTGITLPSGSDKLYSGSEDETVRVWDCQSGQLAGVVNLGCSVGCMLSEGPWVFVGLTNLVKAWNVQTSMELSLSGPVGQVYSLVVGNDLLFAGNKDGTILAWKFNAAT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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