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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003681`

染色体: Chr03 坐标: 55654653-55655777 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003681`
名称	SmilChr03G003681
描述	uncharacterized SmilChr03G003681
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	55654653 - 55655777 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014549`
GeneID	`131014549`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014549`
原始查询	`SmilChr03G003681`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0677600; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os02g0677600; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G62140` (AT5G62140) ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836334] identity=55.3; qcov=0.971; evalue=3.24e-76; confidence=high
Rice	`Os02g0677600` - identity=58; qcov=0.855; evalue=8.11e-81; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014549

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057798536.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.80000	`XP_057798536.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057798536.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798536.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798536.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:55654838`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	127	A10,A13,A14,A18,A2,A20,A21,A23,A25,A3,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B106,B107,B108,B109,B111,B113,B118,B119,B12,B122,B123,B125,B126,B127,B13,B132,B134,B135,B140,B18,B20,B22,B23,B25,B26,B3,B33,B34,B35,B37,B4,B40,B43,B44,B45,B48,B50,B53,B54,B56,B6,B61,B62,B63,B65,B66,B67,B68,B7,B73,B74,B79,B8,B80,B81,B84,B85,B86,B87,B91,B93,B94,B97,B98,C10,C15,C18,C19,C2,C23,C25,C26,C27,C29,C30,C33,C34,C37,C38,C4,C42,C45,C47,C48,C53,C54,C55,C6,C62,C63,C64,C66,C67,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C77,C78,C79,C80,C82,C84,C87,D10,D11,D2,D5,D6
`Chr3:55654845`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C34,C5
`Chr3:55654845`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C34,C5
`Chr3:55654848`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A7,B48
`Chr3:55654848`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A7,B48
`Chr3:55654936`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B50,B78,C33
`Chr3:55655383`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B129,B50,B78,C33
`Chr3:55655402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,B53
`Chr3:55655409`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:55655478`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B75,D10
`Chr3:55655490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942553.1
AGAGAGGATGAGGACCTCAACTCATGGTCTCATACTGGCCTCACATTAGACTATCTAAAATGGAAGCTCCGATATATTCTGAAAAAATGTACTGTATTATAGTTTAACGCTCAAACATTCTCTTTTTGCAGAAACTAAACAACACCATATAATGGGGTGCCAAACCCTCCATCTCAATCCTCAATTTCTCTACAACGCACCAAACACAAGACGTTTCTCTCTCCAACCAAACCTTAAACTCCTCAAAACTACCTCTCTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014549
ATGGGGTGCCAAACCCTCCATCTCAATCCTCAATTTCTCTACAACGCACCAAACACAAGACGTTTCTCTCTCCAACCAAACCTTAAACTCCTCAAAACTACCTCTCTATCCTCCAACAACCTAAACGAACCACTTTCAACTGCCACAATCAATCAAACACAAAACCCCACAACTCATTCATCCAACGTTAACTTCAAAACTCTAGGAGATTGCAAGCTCGGCATTTCCCGATACCCTGACTTCGACTACAATGCTTCCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798536.1
MGCQTLHLNPQFLYNAPNTRRFSLQPNLKLLKTTSLSSNNLNEPLSTATINQTQNPTTHSSNVNFKTLGDCKLGISRYPDFDYNASGGAGSGTATKLSDGQVYVEFDVKKLSIPPLSTATTTFLGLPLPPFLKIDIVPVAFQGEINQESGKVDLKFIAEFCFSVGSLYKARPLLVETVLTSEESKGKMREGRGERMDGDGKCRLVGVATVEPINDLFMDTFLSLPTECLANLNAVISFSTTE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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