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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003682`

染色体: Chr03 坐标: 55655627-55661892 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003682`
名称	SmilChr03G003682
描述	ABC transporter B family member 28-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	55655627 - 55661892 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014547`
GeneID	`131014547`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014547`
原始查询	`SmilChr03G003682`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ABC transporter B family member 28-like
产物	ABC transporter B family member 28-like
Arabidopsis	`AT4G25450` (ABCB28) non-intrinsic ABC protein 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828650] identity=73; qcov=0.917; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0464600` (OsABCB26) - identity=67.2; qcov=0.945; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0015421 (ABC-type oligopeptide transporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	smil02010 (ABC transporters - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00005 (ABC_tran); PF00664 (ABC_membrane)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014547

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057798534.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057798534.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798534.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798534.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798534.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:55656202`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B133
`Chr3:55656202`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr3:55656279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B133
`Chr3:55656550`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr3:55656577`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B67,B81,C25,D5
`Chr3:55656591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B124,B71,C36,C45
`Chr3:55656712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C45
`Chr3:55656751`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,B51,C4
`Chr3:55657292`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A5,B106,B3,B33,B81,B83,C37,C43,C55,C59
`Chr3:55657299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr3:55657304`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C43,C55
`Chr3:55657304`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C43,C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798534.1

722 aa

361

722

ABC_membrane

ABC_tran

PF00664 ABC_membrane 120-390 aa PF00005 ABC_tran 496-647 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798534.1`	Pfam	`PF00664`	ABC_membrane	Family	120	390	3.1e-35	122.9	ABC transporter transmembrane region
`XP_057798534.1`	Pfam	`PF00005`	ABC_tran	Domain	496	647	3.8e-33	115.7	ABC transporter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942551.1
TTTCATGAATGTGTGTTCGAACTTCGAAATAAGGACTAGAATCCAAAATCTAATTAGTAACTCGTTGTTGTTGCTTTATCAAATTTGCAATCAAATTCAGAAGATAATCAAGAAAATTTTTCTTGCACGCATTTCACAAGCCTTTTTGTTGTATTATAAATCATGAACTAACACTCGACACTCTCCAACCACCAAAAAAATGGCAGCAGCTGCAGCAACGCCTCTTGCACCTTCCTTCAACCTCTATTCCCCCAAACACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014547
ATGGCAGCAGCTGCAGCAACGCCTCTTGCACCTTCCTTCAACCTCTATTCCCCCAAACACTTGATTAAATTCAAAACTTCAAGATTGAAGCTCAAGCTCAGCAACAATCTAAACAGGCAGTCTGTTTCTTGCTTGCCCGCTTCGTTTTCTCGGCCAGTATCTGTTAAAGGATCAAGAGCTTTAGCAGCATCAAGTATCATCAGACGGGCCTATGTTTCGGGCCCGGCTTTCGACGCAATCGTGTCGGAGGTTGACCCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798534.1
MAAAAATPLAPSFNLYSPKHLIKFKTSRLKLKLSNNLNRQSVSCLPASFSRPVSVKGSRALAASSIIRRAYVSGPAFDAIVSEVDPKIDGTYIVELQPLDVISWGLLWKLVSRHKWRALASVLTLFGCTSCTLAMPLYSGKFFEVLIGARPEPIWQLLSKVGILYTLEPIFTIIFVVNMNGIWEKVMSSLRAQIFQRVLIQKVEFFDKYKVGELTSLLTSDLGSLKTIVSDNISRDRGFRAISEVIGTLCLLFALSPQLA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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