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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003686`

染色体: Chr03 坐标: 55753625-55764329 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003686`
名称	SmilChr03G003686
描述	uncharacterized SmilChr03G003686
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	55753625 - 55764329 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019030`
GeneID	`131019030`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019030`
原始查询	`SmilChr03G003686`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0208400` - identity=33.6; qcov=0.909; evalue=1.48e-133; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02992 (Transposase_21); PF13963 (Transpos_assoc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019030

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803699.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057803699.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057803699.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803699.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803699.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:55753633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr3:55753669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr3:55753686`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr3:55753745`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B32,B40,B94,C28
`Chr3:55753770`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr3:55753778`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr3:55753782`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr3:55753811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr3:55753821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr3:55753833`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr3:55761417`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr3:55761479`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803699.1

810 aa

405

810

Transpos_assoc

Transposase_21

PF13963 Transpos_assoc 5-81 aa PF02992 Transposase_21 291-503 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803699.1`	Pfam	`PF13963`	Transpos_assoc	Domain	5	81	2.5e-18	66.7	Transposase-associated domain
`XP_057803699.1`	Pfam	`PF02992`	Transposase_21	Family	291	503	5.1e-79	265.1	Transposase family tnp2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947716.1
TTCGCCCCTACTGCTGTTGCCTGCTGCTTCCACCAGCCGACAGCCGCCGCCGAACCCCGCCGCCGACCGCCGCCGTGCCCAGCCGCCCAGTTCGACGATTTCGTTTCGCCGCTTTCTTCACGACACCCGCCGGAAACCACCACCAATTTGCAAGAATGAGTGATAATCGTACGTGGATGTACGCGAGATACAATGATCGTACTGCATTTGAAACGGGGCTTGAGTTTTTCCTTGAGTGGGCGTTCAATCAAACGGCGTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019030
ATGAGTGATAATCGTACGTGGATGTACGCGAGATACAATGATCGTACTGCATTTGAAACGGGGCTTGAGTTTTTCCTTGAGTGGGCGTTCAATCAAACGGCGTACACAGATGGACAAGGTAACATTAGGTGCCCGTGTAAGAAGTGCAAGAATCAAGCGTATTTAGATGTACCTACGGTCAGAAAACATGTTAGTAGGCGTGGATTTGTCCTGAATTACAAAGTTTGGGTTTGTCACGGGGAAGCACCGCTGTATATGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803699.1
MSDNRTWMYARYNDRTAFETGLEFFLEWAFNQTAYTDGQGNIRCPCKKCKNQAYLDVPTVRKHVSRRGFVLNYKVWVCHGEAPLYMPREHAIMNEDDGLYNNYERMVHDHAGPSNYQDPPNLEQPPNNDAQQIYNMLDAADTPLYAGCDTYTQLSWMTQFMSIKTESHMSERTYNQMSSMMKAALPEGNNCPEDFYSTKRNLRGLGLPVEKIDCCVNNCMLYWGETSELHSCMFCDQSRYKDSLRASGSRRKKQVPAKQM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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