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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003694`

染色体: Chr03 坐标: 55870585-55873266 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003694`
名称	SmilChr03G003694
描述	F-box protein At4g00755
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	55870585 - 55873266 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014561`
GeneID	`131014561`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014561`
原始查询	`SmilChr03G003694`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At4g00755
产物	F-box protein At4g00755
Arabidopsis	`AT4G00755` (AT4G00755) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828014] identity=48.7; qcov=1; evalue=3.57e-104; confidence=high
Rice	`Os03g0116800` (Os_F0716) - identity=52.1; qcov=0.841; evalue=4.41e-106; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014561

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057798555.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057798555.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057798555.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798555.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798555.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:55872227`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:55872406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798555.1

370 aa

185

370

F-box-like

PF12937 F-box-like 15-55 aa

XP_057798556.1

370 aa

185

370

F-box-like

PF12937 F-box-like 15-55 aa

XP_057798557.1

370 aa

185

370

F-box-like

PF12937 F-box-like 15-55 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798555.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	15	55	8.4e-07	29.4	F-box-like
`XP_057798556.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	15	55	8.4e-07	29.4	F-box-like
`XP_057798557.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	15	55	8.4e-07	29.4	F-box-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942572.1
GGAATTTCACTCGTCATTATCTATTGAAGACACTAAACTCTTCTCTATATCATTATCGAACAAACTGTATGTGTTACTCATAATTCATATTCTCTCCATATCTATCGTCTTCGAACAACTGAACAACAATCTTCGGGTTTTTGGGTAATCTACCTGCTTCTTCACTTTTTTGTAAAGTTAGGTTAGAGCGGTGCGATATTTGGTTTCTGGCTGAAAATTGCACAACAAGGATATAAATTTCACAAGAGCAAATGGATGAA...

XM_057942574.1
CTATTGAAGACACTAAACTCTTCTCTATATCATTATCGAACAAACTGTATGTGTTACTCATAATTCATATTCTCTCCATATCTATCGTCTTCGAACAACTGAACAACAATCTTCGGGTTTTTGGGTAATCTACCTGCTTCTTCACTTTTTTGTAAAGGTTAGAGCGGTGCGATATTTGGTTTCTGGCTGAAAATTGCACAACAAGGATATAAATTTCACAAGAGCAAATGGATGAAGGCAGGGATTTTGTTCAATGGCTT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131014561
ATGGATGAAGGCAGGGATTTTGTTCAATGGCTTGGACAAGACATGTCAGTAAAGATCCTTATGTGTTTGGATGACCCTTGTGATCTTGTTCGGACGAGTGCGGTTTCGCGGTCTTGGCGCGAGTTTGTGATTGCTAATGGCCTGTGTAAGAAACTTTGCTTAAGGAAGTATCCTGAAGCGTCGAGTTTTGCCAGTGTTGTTGTAACTAAAGACTTAGTTGAACCTACGGAAACTGGTGTGGGAGGTTATGGTGAATGGGC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057798555.1
MDEGRDFVQWLGQDMSVKILMCLDDPCDLVRTSAVSRSWREFVIANGLCKKLCLRKYPEASSFASVVVTKDLVEPTETGVGGYGEWAYLEREHRVYAFLGKDLITSGRENCITDAVCASSTDNYPDESIKNTLQPSDRIGHRASYWSSKGASDPSASETLIYKLASRLCLITELHVHPFQAYFQFGFPIYSPKAVRFHMGYSKDPLEIEDEQTDDFKDAKEYHDEMFVWTYSSPEFPTAQENFLQKFKLPKPVLCIGGFL...

XP_057798556.1
MDEGRDFVQWLGQDMSVKILMCLDDPCDLVRTSAVSRSWREFVIANGLCKKLCLRKYPEASSFASVVVTKDLVEPTETGVGGYGEWAYLEREHRVYAFLGKDLITSGRENCITDAVCASSTDNYPDESIKNTLQPSDRIGHRASYWSSKGASDPSASETLIYKLASRLCLITELHVHPFQAYFQFGFPIYSPKAVRFHMGYSKDPLEIEDEQTDDFKDAKEYHDEMFVWTYSSPEFPTAQENFLQKFKLPKPVLCIGGFL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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