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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003702`

染色体: Chr03 坐标: 55968492-55972000 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003702`
名称	SmilChr03G003702
描述	probable methyltransferase PMT16
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	55968492 - 55972000 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014568`
GeneID	`131014568`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014568`
原始查询	`SmilChr03G003702`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable methyltransferase PMT16
产物	probable methyltransferase PMT16
Arabidopsis	`AT2G45750` (AT2G45750) S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819183] identity=66.6; qcov=0.973; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0570800` - identity=66; qcov=0.978; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005768 (endosome); GO:0005802 (trans-Golgi network); GO:0008168 (methyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03141 (Methyltransf_29); PF08241 (Methyltransf_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014568

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057798561.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057798561.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798561.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798561.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798561.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:55968808`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B106
`Chr3:55968808`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B106
`Chr3:55968852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C60,D11
`Chr3:55969103`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,B115,C3
`Chr3:55969121`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D1
`Chr3:55969121`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D1
`Chr3:55969309`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B58,C46,C63
`Chr3:55969364`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B58,C23,C46,C63
`Chr3:55969400`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr3:55969424`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B65,B7,B77,C42
`Chr3:55969465`	`A`	`ACC`	2bp_insertion	frameshift_variant	33	A20,B1,B100,B103,B106,B111,B112,B117,B124,B129,B23,B24,B35,B37,B49,B50,B63,B79,B86,B88,B90,B97,B99,C1,C14,C46,C64,C66,C7,C71,C72,C73,C82
`Chr3:55969469`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	31	A20,B1,B100,B103,B106,B111,B112,B117,B129,B134,B23,B24,B35,B37,B49,B50,B63,B79,B86,B88,B97,B99,C1,C14,C46,C66,C7,C71,C72,C73,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798561.1

637 aa

318

637

Methyltransf_29

Methyltransf_11

PF03141 Methyltransf_29 116-625 aa PF08241 Methyltransf_11 234-327 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798561.1`	Pfam	`PF03141`	Methyltransf_29	Family	116	625	4.8e-226	751.9	Putative S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase
`XP_057798561.1`	Pfam	`PF08241`	Methyltransf_11	Domain	234	327	4.2e-09	37.6	Methyltransferase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942578.1
ACCTTAAAATTTGCAATATATATTTTGAGTTTGAGGTGTTGTTATCAACAAAAGTGTGTTCTACCATCCCCTATAAGTATCAAATAAGCTAGTCTCCCCCCTCTCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATACACGCTCACAACCCACATGTTCTACTTGATTCTTAACTTGTCTCCCCTTCGCACTCCTCAAAATTTCTAACAAGCAAGCATCCCCACCCAACCATTTTCTACTTGTATAAACTCCTACACATACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014568
ATGGGGGGTTCTAGCCCAGCACACTACACTCCTCTCTCAAAACCAACACCCACCGCCGTCTCCTTCTTCAAGAAATCCAAACTCTATCCACTCGCTATCGTCACCATCCTCTGCTCCCTCTCCTACCTCTTTGGCGCCTGGCACCACGCCGGCGCCACCACCGACCCCTCCCTCGGCACCACCATCAATTGCTTCACCACCTCCCGAAACACCACCAACGCCCCCACCACCACCAACGCGCAACAACAACAACAACTAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798561.1
MGGSSPAHYTPLSKPTPTAVSFFKKSKLYPLAIVTILCSLSYLFGAWHHAGATTDPSLGTTINCFTTSRNTTNAPTTTNAQQQQQLDFATHHTAQDDIAATAAIKEFPPCDVKYSEYTPCEDQERSLKFERDRLIYRERHCPEKKELLKCRIPPPHGYQNPFKWPLSRDLAWYANVPHKELTVEKAVQNWIRFEGDRFRFPGGGTMFPNGADAYIDDIGKLINLKDGSIRTAIDTGCGVASWGAYLLSRNVLTMSFAPRD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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