Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003709`

染色体: Chr03 坐标: 56025679-56027088 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003709`
名称	SmilChr03G003709
描述	CEN-like protein 1
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	56025679 - 56027088 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014574`
GeneID	`131014574`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014574`
原始查询	`SmilChr03G003709`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CEN-like protein 1
产物	CEN-like protein 1
Arabidopsis	`AT5G62040` (BFT) PEBP (phosphatidylethanolamine-binding protein) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836324] identity=66.1; qcov=1.01; evalue=2.19e-85; confidence=high
Rice	`Os12g0152000` (Rcn3) - identity=75.7; qcov=1; evalue=2.23e-98; confidence=high
GO	GO:0009908 (flower development); GO:0010228 (vegetative to reproductive phase transition of meristem)
KEGG	-
Pfam	PF01161 (PBP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014574

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798569.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798569.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057798569.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798569.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798569.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798569.1

173 aa

173

PBP

PF01161 PBP 58-162 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798569.1`	Pfam	`PF01161`	PBP	Domain	58	162	8.1e-16	59.4	Phosphatidylethanolamine-binding protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942586.1
GATTCCTAGTAATTAAGAAGTGGAAATTGAAGAAATGGTCTATTCCATGTGCCTCCTTCTCCCAAAAGTTGATTAATTGGCATCATCTGCTTTCCCAGCTCAGTAGCAAAGTTCTATCAGGCATGTTTTGTTGAGCACATAGACACCTTTTTTGTATGCATGCAGAGATTCCTAAGAATCTTTTCAACTTCAAATCCTAGCCCTCCACTTCACTATAAAAAGCCCCCTCACAACTTCAACATCTCTCACAACACAAAAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014574
ATGTCGAGGTTGCTAGACTCTCTCTCCGTAGGCAGAGTTGTGGGAGAAGTTGTCGACAACTTCGTACCTTGTGTGAAGCTGATTGTAACATACAACAGCAACAAGCAAGTCTGCAATGGCCATGAGCTCATGCCTGCTGTCATTATGGCTAAACCACGAGTCGATATTGGTGGAGAAGACATGAGAGCTGCTTACACTCTTGTCATGACTGATCCTGATGTTCCAGGCCCTAGTGATCCATACTTGAGGGAGCATCTTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798569.1
MSRLLDSLSVGRVVGEVVDNFVPCVKLIVTYNSNKQVCNGHELMPAVIMAKPRVDIGGEDMRAAYTLVMTDPDVPGPSDPYLREHLHWIVTDIPGTTDASFGRETVSYEAPKPVIGIHRYVFVLFKQRGRQTVRPPASRDCFNTRAFAEENGLGLPVAAVYFNAQRETACRRR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器