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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003722`

染色体: Chr03 坐标: 56241566-56245128 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003722`
名称	SmilChr03G003722
描述	uncharacterized SmilChr03G003722
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	56241566 - 56245128 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014586`
GeneID	`131014586`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014586`
原始查询	`SmilChr03G003722`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AGAMOUS-like 18 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824906]; symbol=AGL18; hit=AT3G57390; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AGAMOUS-like 18 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824906]; symbol=AGL18; hit=AT3G57390; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G57390` (AGL18) AGAMOUS-like 18 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824906] identity=28.6; qcov=0.835; evalue=3.26e-06; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF01486 (K-box)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014586

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798579.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798579.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798579.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798579.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057798579.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:56242609`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr3:56243471`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B139,C63
`Chr3:56243471`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B139,C63
`Chr3:56243812`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr3:56243848`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B49
`Chr3:56243848`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798579.1

109 aa

109

K-box

PF01486 K-box 34-99 aa

XP_057798580.1

109 aa

109

K-box

PF01486 K-box 34-99 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798579.1`	Pfam	`PF01486`	K-box	Family	34	99	2.3e-09	38.0	K-box region
`XP_057798580.1`	Pfam	`PF01486`	K-box	Family	34	99	2.3e-09	38.0	K-box region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942597.1
TTCACTACAAAAAAACGCTAGATTTAGCTACGGAATTAGCTAAGGAAATTATTCTGTAGCTATTCTGTGACGGAATTACAACGGATTAGCTACGGAAATAATTTGTTGAATTTAGCAACGGATTTAACGACGGATTTCCGTAGCAATACTTTCGCTACGGATATATTCCGTCATTAAAGTCAAAAAAATTACTAATTTTTGTTAAAAAAATTTAGCTACGGAATAACTGTAGTTAAATCCGTAGCTAAACTAAAATTTAA...

XM_057942596.1
TTCACTACAAAAAAACGCTAGATTTAGCTACGGAATTAGCTAAGGAAATTATTCTGTAGCTATTCTGTGACGGAATTACAACGGATTAGCTACGGAAATAATTTGTTGAATTTAGCAACGGATTTAACGACGGATTTCCGTAGCAATACTTTCGCTACGGATATATTCCGTCATTAAAGTCAAAAAAATTACTAATTTTTGTTAAAAAAATTTAGCTACGGAATAACTGTAGTTAAATCCGTAGCTAAACTAAAATTTAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131014586
ATGCAGAAAATTATAACCAAATTCAAGATGTGCAAGGAGCTTGGCATTCGTGCTGCAATGCAGTCAAAACCAGAAAACCCCGACGAAGAGGTGCAGAAGGAGGCTGGTGTTAGGAAATTTCTGGGTAAGGACTTAGCACAGATGAGCTCACAGGAATTATCTGAGCTTGATGATAAATTAATCAAAGGGCTGTTGTTCATAAAGGATACAAAGCTGCAACTGTTGAAGGATGAAGTGGAAAAATCAAGAATGCAGCAACT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057798579.1
MQKIITKFKMCKELGIRAAMQSKPENPDEEVQKEAGVRKFLGKDLAQMSSQELSELDDKLIKGLLFIKDTKLQLLKDEVEKSRMQQLQVVQKNQMLLRQANPSPTLYDK

XP_057798580.1
MQKIITKFKMCKELGIRAAMQSKPENPDEEVQKEAGVRKFLGKDLAQMSSQELSELDDKLIKGLLFIKDTKLQLLKDEVEKSRMQQLQVVQKNQMLLRQANPSPTLYDK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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