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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003725`

染色体: Chr03 坐标: 56269223-56269672 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003725`
名称	SmilChr03G003725
描述	uncharacterized SmilChr03G003725
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	56269223 - 56269672 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019033`
GeneID	`131019033`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019033`
原始查询	`SmilChr03G003725`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0630250; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0630250; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os02g0630250` - identity=31.7; qcov=0.698; evalue=3.24e-06; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019033

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803701.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803701.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057803701.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803701.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803701.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:56269255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr3:56269267`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B118,B127,B128,B91,C16,C7,D7
`Chr3:56269276`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	157	A1,A10,A15,A16,A18,A2,A21,A22,A23,A24,A5,A6,A7,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B11,B111,B112,B113,B114,B12,B120,B122,B124,B126,B13,B131,B132,B134,B135,B137,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B2,B20,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B32,B33,B35,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B51,B52,B54,B55,B56,B57,B6,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B7,B74,B76,B77,B79,B81,B82,B83,B84,B86,B89,B9,B94,B96,B98,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C17,C19,C21,C28,C29,C30,C34,C35,C36,C39,C4,C41,C45,C47,C48,C5,C50,C51,C54,C55,C56,C57,C59,C6,C60,C62,C63,C64,C66,C67,C69,C70,C71,C73,C75,C78,C79,C80,C81,C82,C86,D1,D10,D3,D4,D5,D6,D8,D9
`Chr3:56269309`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	20	A16,A22,B1,B101,B107,B135,B140,B17,B35,B39,B45,B54,B64,B76,B9,C62,C63,C79,D10,D8
`Chr3:56269358`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B94,C50,C54
`Chr3:56269379`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:56269381`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B6,B95,C34
`Chr3:56269398`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	31	A4,B108,B109,B11,B110,B115,B121,B123,B124,B127,B130,B131,B133,B14,B19,B22,B35,B53,B58,B67,B94,C23,C29,C3,C31,C37,C46,C76,C8,D10,D4
`Chr3:56269399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	B102,B105,B106,B12,B132,B55,B63,B89,C34,C35,C6
`Chr3:56269406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B6,B95,C34
`Chr3:56269420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B6,B95,C34
`Chr3:56269421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B134,B34,B86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803701.1

149 aa

149

RVT_3

PF13456 RVT_3 13-117 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803701.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	13	117	2.8e-16	60.3	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947718.1
ATGGGTCTATCCAGAATGACATCATGCACGCTGGAGGGGTTATTCATAATGCATAACAATGAGGTGATCGGTTGCTTCCATTTCTCTGGGGGTAGGGGCTCTGCTTTTGAAGCGGAGCTTTTTGCTCTCATTATCGCTATTGAAAGCGCTCATAAAGCGGGTTGGCAACATGTCTGGTTTGACGCCGACTCCACATTCGTGGTTAGTCTCATGAGTTTTCGTTCTTTAAATATTCCTTGGCGTTTCAAAGCTCGCTGGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019033
ATGGGTCTATCCAGAATGACATCATGCACGCTGGAGGGGTTATTCATAATGCATAACAATGAGGTGATCGGTTGCTTCCATTTCTCTGGGGGTAGGGGCTCTGCTTTTGAAGCGGAGCTTTTTGCTCTCATTATCGCTATTGAAAGCGCTCATAAAGCGGGTTGGCAACATGTCTGGTTTGACGCCGACTCCACATTCGTGGTTAGTCTCATGAGTTTTCGTTCTTTAAATATTCCTTGGCGTTTCAAAGCTCGCTGGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803701.1
MGLSRMTSCTLEGLFIMHNNEVIGCFHFSGGRGSAFEAELFALIIAIESAHKAGWQHVWFDADSTFVVSLMSFRSLNIPWRFKARWIQALSYAAAISYQISHIFREGNRIADYLASHVKDEGYWPHDVADIRQLVIEDLNLHFFTRVVV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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