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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003726`

染色体: Chr03 坐标: 56287274-56287975 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003726`
名称	SmilChr03G003726
描述	uncharacterized SmilChr03G003726
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	56287274 - 56287975 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019034`
GeneID	`131019034`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019034`
原始查询	`SmilChr03G003726`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=48.6; qcov=0.635; evalue=3.02e-30; confidence=medium
Rice	`Os06g0597250` - identity=50.2; qcov=0.974; evalue=5.32e-73; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019034

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803702.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057803702.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803702.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803702.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803702.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:56287326`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr3:56287337`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	44	A13,A20,A22,A25,B103,B125,B128,B15,B2,B21,B24,B31,B38,B41,B5,B73,B78,B82,B87,C10,C18,C2,C20,C30,C31,C32,C35,C42,C43,C49,C6,C63,C65,C67,C68,C70,C71,C73,C74,C75,C85,C9,D5,D6
`Chr3:56287358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	35	A1,B1,B101,B106,B107,B108,B112,B113,B126,B140,B15,B16,B23,B28,B3,B33,B47,B62,B66,B7,B81,B86,B98,C12,C14,C17,C29,C30,C41,C45,C48,C56,C59,C60,C80
`Chr3:56287367`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,B63,B83
`Chr3:56287376`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B91,C29,C9
`Chr3:56287423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,B70,C17,C64,D2
`Chr3:56287435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B72,C29,C8,D9
`Chr3:56287437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B72,C8,D9
`Chr3:56287439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B72,C8,D9
`Chr3:56287486`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B6,B95,C34
`Chr3:56287508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:56287529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B68,B99,C14,C37,C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803702.1

233 aa

116

233

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 58-96 aa PF04827 Plant_tran 165-233 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803702.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	58	96	2.6e-17	63.0	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057803702.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	165	233	2.3e-28	99.9	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947719.1
ATGTTTTCCTCCTCATCAAGCCACGAGGACGAGCGACGTGCTAAAGAATTTTCCAATCTTGTGCAAGAATTTAACCAAATTGTTCAAGATATTGGTGATCCAGATGAGCAACCTCGTCGTCGGCGACGAAGCGTGGCAAAGAAGGCCTACATTCGTCGGGACCGTGAAGCCGGCGCTCTACGTTTGCACGTGGATTACTTTGATGAAAATCCGGTCTACCCCTACAACATCTTCCGTCGTCGATTTCGGATGCATCGTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019034
ATGTTTTCCTCCTCATCAAGCCACGAGGACGAGCGACGTGCTAAAGAATTTTCCAATCTTGTGCAAGAATTTAACCAAATTGTTCAAGATATTGGTGATCCAGATGAGCAACCTCGTCGTCGGCGACGAAGCGTGGCAAAGAAGGCCTACATTCGTCGGGACCGTGAAGCCGGCGCTCTACGTTTGCACGTGGATTACTTTGATGAAAATCCGGTCTACCCCTACAACATCTTCCGTCGTCGATTTCGGATGCATCGTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803702.1
MFSSSSSHEDERRAKEFSNLVQEFNQIVQDIGDPDEQPRRRRRSVAKKAYIRRDREAGALRLHVDYFDENPVYPYNIFRRRFRMHRALFLCIVNVVASDSYFQQRSDALGRPGFTPLQKCTVDVHMLANGGAADQYDEYLRTAESTSLECLRRFSRAIIQLFGAEYLRRPTSADCQRLLAMHEAKHGFPGMLGSLDCMHWPWKNCPTAWQGAYTRGDQGEPTIILEAVASQDL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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