当前解析结果
SmilChr03G003728| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003728 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003728 |
| 描述 | probable membrane-associated kinase regulator 6 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 56300804 - 56303849 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131014590 |
|---|---|
| GeneID | 131014590 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131014590 |
| 原始查询 | SmilChr03G003728 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | probable membrane-associated kinase regulator 6 |
| 产物 | probable membrane-associated kinase regulator 6 |
| Arabidopsis | AT5G52900 (MAKR6)membrane-associated kinase regulator [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835367] identity=39.9; qcov=0.975; evalue=3.99e-31; confidence=medium |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF30942 (MAKR6) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131014590 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057798584.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057798584.1 |
| 3 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.60000 | XP_057798584.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057798584.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057798584.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:56301237 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B135,B38,B39,C41,C81 |
Chr3:56301252 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B118,B127,C7 |
Chr3:56301348 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A6 |
Chr3:56301504 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A16,B35 |
Chr3:56301519 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B118,B127,C7 |
Chr3:56301660 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | A15,B76,B9 |
Chr3:56301660 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | A15,B76,B9 |
Chr3:56301903 |
G |
GT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 30 | A16,A23,B100,B102,B104,B120,B126,B136,B137,B139,B25,B26,B27,B46,B58,B59,B61,B83,B84,B99,C21,C45,C5,C52,C57,C59,C72,C82,C86,D8 |
Chr3:56301923 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057798584.1PF30942
MAKR6 29-238 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057798584.1 |
Pfam | PF30942 |
MAKR6 | Family | 29 | 238 | 7.5e-81 | 272.2 | Membrane-associated kinase regulator 6 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。