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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003731`

染色体: Chr03 坐标: 56344159-56354969 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003731`
名称	SmilChr03G003731
描述	uncharacterized SmilChr03G003731
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	56344159 - 56354969 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014593`
GeneID	`131014593`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014593`
原始查询	`SmilChr03G003731`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	timeless family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835368]; symbol=ATIM; hit=AT5G52910; species=arabidopsis; confidence=high
产物	timeless family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835368]; symbol=ATIM; hit=AT5G52910; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G52910` (ATIM) timeless family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835368] identity=46.2; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0210500` - identity=49.5; qcov=0.79; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000076 (DNA replication checkpoint signaling); GO:0003677 (DNA binding); GO:0006281 (DNA repair); GO:0031298 (replication fork protection complex); GO:0043111 (replication fork arrest)
KEGG	-
Pfam	PF04821 (TIMELESS); PF27570 (TOF-1-like_helical)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014593

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798591.1`
2	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057798591.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057798591.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.40000	`XP_057798591.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798591.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:56344386`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr3:56344403`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr3:56344433`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B1,B101,D6
`Chr3:56344463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr3:56344640`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B101,D6
`Chr3:56345492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr3:56346076`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr3:56346707`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr3:56346985`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:56347189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:56347203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr3:56347493`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798591.1

1232 aa

616

1232

TIMELESS

TOF-1-like_helical

PF04821 TIMELESS 25-285 aa PF27570 TOF-1-like_helical 678-778 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798591.1`	Pfam	`PF04821`	TIMELESS	Family	25	285	3.1e-59	201.2	Timeless protein
`XP_057798591.1`	Pfam	`PF27570`	TOF-1-like_helical	Domain	678	778	5.8e-31	107.6	TOF1-like, helical domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942608.1
ACTCTTAGTCCCGCCACTCTTAATAAAAAGGGCGGGAAACTTTACTATGGCTATCATCATCTGAAGACTCACATCCCTAATACCAGAAATTCTCAGATCCAAATCTCCTACATCCTTCCACCAGCATTAGGTATTTCTCATATATCAGTTTCCCCAAAATTCAGCGTTTAATTCGAGGAACATGGATGGATTATCAACCATTTGTGCTGGGCTAGGAATAGTTGAAGAAGATGACAATGGGAAGCGCATTGGATATGCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014593
ATGGATGGATTATCAACCATTTGTGCTGGGCTAGGAATAGTTGAAGAAGATGACAATGGGAAGCGCATTGGATATGCTAAGGGAGAGTATTGTTTAGATAACTTGAAGGATCTATTAAGGTTTCTACGGCGCGATGATCCGGAGAAAAGGGATGTATTCAAGCAAGTTTGTAAATGGAATACTGTGGGGAAGGATTTGATCCCGATTATTGAGTATTTCCAGGAAGACCGTAATTTGGTGCTGAATGCAGTGAAAGTGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798591.1
MDGLSTICAGLGIVEEDDNGKRIGYAKGEYCLDNLKDLLRFLRRDDPEKRDVFKQVCKWNTVGKDLIPIIEYFQEDRNLVLNAVKVLVFLTMPVEPTSVDIFQQIEYLWGLKSAITFSDIIPVIVSLLESPLENLESGSFTEDDWKLVQLVLTLFRNVLAIQDISTQQKAAGSATQFLFIRDSFLELLFQENVMDLILVLSQHTGGSQGYLRQDNLLLLETYYHIFKGQDPELIAKAYLKSYEVEDNAENLVSSLQSIMK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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