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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003736`

染色体: Chr03 坐标: 56383169-56387006 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003736`
名称	SmilChr03G003736
描述	uncharacterized SmilChr03G003736
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	56383169 - 56387006 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014597`
GeneID	`131014597`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014597`
原始查询	`SmilChr03G003736`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LIM domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835372]; symbol=AT5G52950; hit=AT5G52950; species=arabidopsis; confidence=low
产物	LIM domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835372]; symbol=AT5G52950; hit=AT5G52950; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G52950` (AT5G52950) LIM domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835372] identity=34.6; qcov=1.06; evalue=6.71e-123; confidence=low
Rice	`Os01g0222300` - identity=32.9; qcov=0.386; evalue=2.54e-36; confidence=low
GO	GO:0003682 (chromatin binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006260 (DNA replication); GO:0007095 (mitotic G2 DNA damage checkpoint signaling); GO:0010212 (response to ionizing radiation); GO:0030174 (regulation of DNA-templated DNA replication initiation); GO:0033314 (mitotic DNA replication checkpoint signaling)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014597

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798597.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798597.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798597.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798597.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057798597.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:56383451`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr3:56383572`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B20,B68
`Chr3:56383696`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr3:56384617`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:56384628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr3:56384981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:56385043`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C44,C83
`Chr3:56385045`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr3:56385149`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr3:56385228`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:56385394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:56385522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942614.1
TTTCCCGCCCGCAGCGCATATTAGATTTCCCCCTCCGATCTTATCCCATTTTTTCTCCTGTCGCTCACTTTGATGCCGGAACATTACACATCCGGCGCACGTTAGTCTTGCCACCGCCAAATGAACCCTCCGTCAATGTTGCTGGCGGATCGGCAGCCACTGGATTTCTCGGAAACTCAACGTTTAGTCCTCCTCATTGACCTAGATCCAATTCTCACACTCCAAAACCCTTCCTCCTACTTCTCCGCCGTCATATCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014597
ATGAACCCTCCGTCAATGTTGCTGGCGGATCGGCAGCCACTGGATTTCTCGGAAACTCAACGTTTAGTCCTCCTCATTGACCTAGATCCAATTCTCACACTCCAAAACCCTTCCTCCTACTTCTCCGCCGTCATATCCGCCGCAAACCGCCTCCTCCGTTTTCCTCCGCTTTCCGCCACCCTCTCTGCCTTCAAACTCTTCTTCTCCTCCCTCTCTCCGCTGCGTTCTGCCGCAGCTCTCCCCCGCCTACTCTCTACACG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798597.1
MNPPSMLLADRQPLDFSETQRLVLLIDLDPILTLQNPSSYFSAVISAANRLLRFPPLSATLSAFKLFFSSLSPLRSAAALPRLLSTRSLSFNLPPETLDSLSTTLNCISSLTDLPNSTCCPRASYAASSLLQLVHDYAWESELDRLSGEGGFTDGGFVKIPSNLIILFSPIGQSVNSLVDYLEMREFNDAFCVVREAFSVRDIHLCWVDVKIDESEIDKKNGCGERLVAMRDEIRKIGWGFCSSDLIVLCSVLLPLALIY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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