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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003740`

染色体: Chr03 坐标: 56458845-56460661 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003740`
名称	SmilChr03G003740
描述	uncharacterized SmilChr03G003740
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	56458845 - 56460661 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014603`
GeneID	`131014603`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014603`
原始查询	`SmilChr03G003740`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ubiquitin-associated/translation elongation factor EF1B protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835414]; symbol=AT5G53330; hit=AT5G53330; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Ubiquitin-associated/translation elongation factor EF1B protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835414]; symbol=AT5G53330; hit=AT5G53330; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G53330` (AT5G53330) Ubiquitin-associated/translation elongation factor EF1B protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835414] identity=53; qcov=1.03; evalue=4.58e-71; confidence=high
Rice	`Os06g0160400` (HGW) - identity=55.8; qcov=0.721; evalue=4.86e-48; confidence=medium
GO	GO:0000813 (ESCRT I complex); GO:0043130 (ubiquitin binding); GO:0043162 (ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway)
KEGG	-
Pfam	PF21267 (UBA2_UBAP-1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014603

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798611.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057798611.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057798611.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057798611.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.60000	`XP_057798611.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:56459406`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,C7
`Chr3:56459816`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C54
`Chr3:56459871`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B104,C45
`Chr3:56460427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr3:56460431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798611.1

226 aa

113

226

UBA2_UBAP-1

PF21267 UBA2_UBAP-1 185-222 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798611.1`	Pfam	`PF21267`	UBA2_UBAP-1	Domain	185	222	2.4e-15	57.2	Ubiquitin-associated protein 1, UBA2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942628.1
TATTATTCTAAACTCAACTCTCAAACTGAATCTGTGTTAGTTAAAATGTTTTTTATTAATTTTTTCACAAAATATATTCAATGAAAATTATTTTTTTTATTATATTTATAAATATGATAATTGAGTTGATATTAACTTTATATAAATATAAAAATATTTTGTGTAATGGAATGCTGCTAGTTAACTCTAATAAATTACTGAGTTTATGAACCCAAATCGGCCCTATTAGGCATTTTCTTTTAATCAAATCAGTTAAGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014603
ATGGAGTACGATTTCAGAAAACGAACCGCGCCACCGTACGATTCCAACACGCCGTCGTACGGCCGGGCTCCCTCCACCGCTGCCGCGTCATCGGCCGCCGCTTCTCATCCGGTCTACGGTCAACAATCTTTACTCTACCCAAAGATCGGCAGCTCCGGCCCTCAGTCAGCCACCCCGCATGTCCGCAACGCCCCGTTTCACCACGCGCCACTTCCCCCTTCTAATTCTGGGATCGGGATTAGGGTTGCTATCAAACCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798611.1
MEYDFRKRTAPPYDSNTPSYGRAPSTAAASSAAASHPVYGQQSLLYPKIGSSGPQSATPHVRNAPFHHAPLPPSNSGIGIRVAIKPEYRITPPPPLLPHLGEIPRSNFHFDFEFERNVLTEAVKENPNWGRLGIDNAPPKANEPTPSYGPAADPVVSKYIAAGLSREAVPLAVANYGDNPSKVKEFANGFTLLREMGFSSNNVAEALIMYDNDTDKALAQLINAPS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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