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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003748`

染色体: Chr03 坐标: 56540684-56545784 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003748`
名称	SmilChr03G003748
描述	ABC transporter F family member 4-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	56540684 - 56545784 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014605`
GeneID	`131014605`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014605`
原始查询	`SmilChr03G003748`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ABC transporter F family member 4-like
产物	ABC transporter F family member 4-like
Arabidopsis	`AT3G54540` (ABCF4) ral control non-repressible 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824619] identity=78.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0441500` (OsABCF2) - identity=70.3; qcov=0.99; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	-
Pfam	PF00005 (ABC_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014605

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798613.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057798613.1`
3	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057798613.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057798613.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798613.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:56541673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,B53,B83,C46,D1
`Chr3:56542063`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr3:56542265`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C54
`Chr3:56542306`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr3:56542336`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr3:56542406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B20,B68
`Chr3:56542417`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B40,C77,D6
`Chr3:56542789`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,D11
`Chr3:56542844`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr3:56543463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr3:56543585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B43,C83
`Chr3:56543608`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798613.1

718 aa

359

718

ABC_tran

PF00005 ABC_tran 173-344 aa PF00005 ABC_tran 508-643 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798613.1`	Pfam	`PF00005`	ABC_tran	Domain	173	344	2.7e-51	174.5	ABC transporter
`XP_057798613.1`	Pfam	`PF00005`	ABC_tran	Domain	508	643	2.7e-51	174.5	ABC transporter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942630.1
GATAAATTCGAAAAACAACATAACACACAAATCACAATACAGTACACTGTACAGTAACAAAAAAAAAATCAAAATCGTGAAAATTAAAGAAACACTCAAACACAACCACACACACAACCGTGACACAACCCTAGCTCGCCCAACCACCGCTTCTCCTCCGCCGTCCCGCCGCGCCCAGCCAGTAGAGCCCGCAGGCCGCAGCTGCCCGCACCCAGCACCCCGAGCACGCAGCCACCCAGCCCAGCACCACACCTCTGCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014605
ATGGGCAAGAAGAAATCAGATGAGGTTGCTGCTGGTTCAAAGTCCAAGCAGGGTGGTAAGGAGAAGTTCTCAGTGACTGAATTACTCGCGAGCATGGACGCAAAACCTGATAAACCGAAGAAAGCCAGCACTTCCAATAAACCTAAGCCAAAAGCTGCTCCTAAAGCTTCATCTTATATTGATGGTATAGATCTTCCTTCATCTGATGAAGAGGATGATGCTTTGGGCTCTGAGGAAGAGGCCCAACTGAATGAGGTAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798613.1
MGKKKSDEVAAGSKSKQGGKEKFSVTELLASMDAKPDKPKKASTSNKPKPKAAPKASSYIDGIDLPSSDEEDDALGSEEEAQLNEVNSRRNIVRPIDTGLTDKALKKRGKKDVLVAQAAEVAKQEALKDDRDAFTVVIGSRASVLDGENDADANVKDITVENFSVAARGKELLKNTSVKISHGKRYGLVGPNGMGKSTLLKLLAWRKIPVPKNIDVLLVEQEVVGDDRTALEAVVSANEELIKLRQEVASLQDASNMSTG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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