当前解析结果
SmilChr03G003752| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003752 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003752 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G003752 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 56595578 - 56597977 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131019037 |
|---|---|
| GeneID | 131019037 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131019037 |
| 原始查询 | SmilChr03G003752 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os09g0122300; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os09g0122300; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os09g0122300- identity=35.9; qcov=0.206; evalue=4.17e-09; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131019037 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057803704.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057803704.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057803704.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803704.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803704.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:56595601 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C37 |
Chr3:56595602 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C19 |
Chr3:56595605 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A1,B61,C3 |
Chr3:56595609 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B111,B57 |
Chr3:56595627 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B19,B87,C24,C28 |
Chr3:56595636 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B97,D2 |
Chr3:56595638 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B27,B97 |
Chr3:56595648 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A10,A21,B111,B78,B8 |
Chr3:56595661 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A18,A2,B30,C19,C25 |
Chr3:56595725 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B102,B50 |
Chr3:56595730 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B67,B74,C40,C6 |
Chr3:56595746 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C80 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。