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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003754`

染色体: Chr03 坐标: 56652733-56654733 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003754`
名称	SmilChr03G003754
描述	ethylene-responsive transcription factor CRF4-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	56652733 - 56654733 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014614`
GeneID	`131014614`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014614`
原始查询	`SmilChr03G003754`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ethylene-responsive transcription factor CRF4-like
产物	ethylene-responsive transcription factor CRF4-like
Arabidopsis	`AT4G27950` (CRF4) cytokinin response factor 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828908] identity=39.7; qcov=1.01; evalue=2.1e-56; confidence=medium
Rice	`Os01g0224100` (OsERF#053) - identity=44.3; qcov=0.567; evalue=2.14e-34; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00847 (AP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014614

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798620.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798620.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798620.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798620.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057798620.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:56653016`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr3:56653296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C27,D2
`Chr3:56653306`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:56653388`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr3:56653443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr3:56653498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:56653546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr3:56653565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr3:56653577`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B40,C77,D6
`Chr3:56653595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C27,D2
`Chr3:56653628`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B40,C77,D6
`Chr3:56653691`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798620.1

358 aa

179

358

AP2

PF00847 AP2 111-160 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798620.1`	Pfam	`PF00847`	AP2	Domain	111	160	3.9e-14	53.4	AP2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942637.1
TACGACTCAATCCCCTTTGATCGTCTCTGAAACAAAAAGGCCCATTTCTTGTTTTCCTTTTTCCTTTCTTCTTTTTTCCGGCAGCCCAAAATCAAAATAAAAAGCCAAATTCATATTCCTCCACGCAGTTGCCGTCGTGCACTTCCGCCATATTCTGGTACAGAGTTCACCAGAGAAATCAATATAATATTTCCAAAACGGTAATTAAATATAAATTGGTCTGCGCATTTTTCGGCGTTACCATATTCACCGATCCTATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014614
ATGGATCACAGCATACTATACCGGCCAGTGAAATACACCGAGCACACACAAACCACCACAAAAATCATGAAGCAAAATCCCAGAAAAACCCTTCCCCATGCTCCAATAAGTGTCCGAATATCTGTAACTGATCCTGACGCCACGGATTCCTCCAGCGACGAAGACGATGACGATCTTTTCCAGAAGCAACGTGTCAAAAGATACATCACTGAAATCAAAATGGAGACAGCTGCCAGTGGCGTCAGCACCAATTGCGGCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798620.1
MDHSILYRPVKYTEHTQTTTKIMKQNPRKTLPHAPISVRISVTDPDATDSSSDEDDDDLFQKQRVKRYITEIKMETAASGVSTNCGRSRAVETLRPKPKPMKTPNEAAPRKFRGVRQRPWGKWAAEIRDPCRRVRLWLGTYNTAEEAAMVYDNAAIKLRGPDALTNFTTPPESNAASVSGYDSGDESHIISSPVSVLRFKGSRSSEDTEPAGLSSQCSEYTDPGPPVPVLGRVKEEIRYNSVDGLNQSRYEPGPVHNDLG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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