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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003765`

染色体: Chr03 坐标: 56790232-56794537 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003765`
名称	SmilChr03G003765
描述	plastidial pyruvate kinase 4, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	56790232 - 56794537 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014624`
GeneID	`131014624`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014624`
原始查询	`SmilChr03G003765`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	plastidial pyruvate kinase 4, chloroplastic
产物	plastidial pyruvate kinase 4%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G49160` (AT3G49160) pyruvate kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824077] identity=55.2; qcov=0.876; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0672300` - identity=36.4; qcov=0.22; evalue=4.39e-21; confidence=weak
GO	GO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0004743 (pyruvate kinase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006096 (glycolytic process); GO:0030955 (potassium ion binding)
KEGG	smil00010 (Glycolysis / Gluconeogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00620 (Pyruvate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00224 (PK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014624

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057798628.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057798628.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798628.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798628.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798628.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:56791005`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,A8,B40,C77
`Chr3:56792732`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B14,B50
`Chr3:56792854`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C38
`Chr3:56792935`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:56793201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr3:56793215`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr3:56793339`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B13
`Chr3:56793339`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B13
`Chr3:56793366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr3:56793470`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr3:56793683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798628.1

751 aa

376

751

PF00224 PK 267-352 aa PF00224 PK 470-714 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798628.1`	Pfam	`PF00224`	PK	Domain	267	352	1.5e-51	176.2	Pyruvate kinase, barrel domain
`XP_057798628.1`	Pfam	`PF00224`	PK	Domain	470	714	1.5e-51	176.2	Pyruvate kinase, barrel domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942645.1
AAGCGTTACTTTAATCAGATATCGCGTTCCTATAGATTCTGGAATCACTAGTCAGGCACACGCCCTCCACATTCCCATCCCCTCTCTCTACATAAAACATTCTACGTTGGCACTGCTCAAAATCCAGAAGAAATTATTCAATATATCGGATCATCGGAGCTCGATTCCTCGCGCTTAAACCTTTCATTTCTGCAGCGGCTTCTTATAGACAGACTTCAGAAAATGATCATAGGAGCAGTTTCAGTTTGCTCTATTGCTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014624
ATGATCATAGGAGCAGTTTCAGTTTGCTCTATTGCTAACCAGGCATCATTTTTGTATCATGCTAGGTTCCCAGATCCCTCAGAAGTCAACTTATATGGGCTCTCCTCATTTCTGCCTTGTAAATCTGGCATTAAAATTCCAGATTATGGGAATCACATATTTCTTCTTCAAGGTCGAGACAAACTCACCCCAAGAGCTGCATATAGCATGCCACCTGAACGTGAGGATGCTCAAAGACAGAGCTCTCCTCATTCCTCAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798628.1
MIIGAVSVCSIANQASFLYHARFPDPSEVNLYGLSSFLPCKSGIKIPDYGNHIFLLQGRDKLTPRAAYSMPPEREDAQRQSSPHSSDYHLFVFPENDENLEEPRKGRAASRMQPSIDLQQIAEKQGNQVTILDKLKAVHLHILAMEQWNASRLKLCHRNYSASAINVLHYLALKSLDTEQIKEELSSIGLMNLETINTHVLSSLSGCIEMLINSRSDSLLGIKVSGEGLPVHQSLGNQNIDLGMTAMVKNSSSNRDLLLG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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