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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003769`

染色体: Chr03 坐标: 56828167-56828637 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003769`
名称	SmilChr03G003769
描述	heat shock protein 78, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	56828167 - 56828637 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014627`
GeneID	`131014627`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014627`
原始查询	`SmilChr03G003769`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	heat shock protein 78, mitochondrial-like
产物	heat shock protein 78%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT3G48870` (HSP93-III) Clp ATPase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824048] identity=51.2; qcov=0.718; evalue=1.74e-22; confidence=medium
Rice	`Os12g0230100` (CLPC2) - identity=50; qcov=0.718; evalue=3.55e-22; confidence=medium
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0034605 (cellular response to heat)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014627

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057798638.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.40000	`XP_057798638.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057798638.1`
4	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057798638.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798638.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:56828229`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A1,B111,B134,B23,B41,B74,C15,C48,C50,C60,D9
`Chr3:56828232`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A9,B117,B42,B43,B5,B56,B96,C50,C8,C83
`Chr3:56828346`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,C21
`Chr3:56828384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr3:56828403`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C75
`Chr3:56828403`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C75
`Chr3:56828516`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B43
`Chr3:56828516`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B43
`Chr3:56828541`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A5,B107,B113,B140,B30,B38,B42,B47,B53,B6,B88,C20,C25,C28,C44,C79,D5,D9
`Chr3:56828554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B115,B97,C21,C75
`Chr3:56828604`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	29	A18,A5,B103,B107,B11,B113,B135,B140,B17,B23,B30,B37,B38,B42,B47,B57,B60,B62,B88,B99,C20,C28,C44,C61,C71,C79,C85,D6,D9
`Chr3:56828608`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	25	A18,A5,B103,B107,B113,B135,B140,B17,B30,B37,B47,B57,B60,B62,B88,B99,C20,C28,C44,C61,C71,C79,C85,D6,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942655.1
TTGAAGATGGTTAGGGTTTCTCCAGAGATTGGCGTGCTAATTGGCTTTTGGATCTTTTATTTTCATAAGATGGAGATATTCAAGCGATTATTTGGGAGCCTACTGCAGAATTATGCAACTGACCTGACTTTGATGGCTGAGAGGGGAGAGTTGCAGGCGGTAATTGGAAGAGAGAAGGAGATGGAGCAACTCATAGATGCCTTGTTGAAGAGACGGAAGAGTAACCCCTGCCTTGTCGGCGATGCCGGCGTCGGCAAAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014627
ATGGTTAGGGTTTCTCCAGAGATTGGCGTGCTAATTGGCTTTTGGATCTTTTATTTTCATAAGATGGAGATATTCAAGCGATTATTTGGGAGCCTACTGCAGAATTATGCAACTGACCTGACTTTGATGGCTGAGAGGGGAGAGTTGCAGGCGGTAATTGGAAGAGAGAAGGAGATGGAGCAACTCATAGATGCCTTGTTGAAGAGACGGAAGAGTAACCCCTGCCTTGTCGGCGATGCCGGCGTCGGCAAAACTGCCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798638.1
MVRVSPEIGVLIGFWIFYFHKMEIFKRLFGSLLQNYATDLTLMAERGELQAVIGREKEMEQLIDALLKRRKSNPCLVGDAGVGKTAIVEGLAIKIAQGSVPDKLKGKRVLINLKFGS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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