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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003787`

染色体: Chr03 坐标: 56969406-56970682 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003787`
名称	SmilChr03G003787
描述	uncharacterized SmilChr03G003787
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	56969406 - 56970682 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014640`
GeneID	`131014640`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014640`
原始查询	`SmilChr03G003787`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsRLCK4; symbol=OsRLCK4; hit=Os01g0113400; species=rice; confidence=low
产物	OsRLCK4; symbol=OsRLCK4; hit=Os01g0113400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os01g0113400` (OsRLCK4) - identity=30.6; qcov=0.614; evalue=3.85e-14; confidence=low
GO	GO:0030247 (polysaccharide binding)
KEGG	-
Pfam	PF13947 (GUB_WAK_bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014640

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057798661.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057798661.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798661.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798661.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798661.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:56969811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr3:56969814`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	A22,A25,B10,B100,B110,B117,B15,B20,B34,B74,B80,C18,C19,C25,C28,C3,C42,C60,C61,C67,C78,C79,D3
`Chr3:56969937`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	B105,B109,B12,B131,B132,B55,B63,B89,C51
`Chr3:56969959`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	119	A14,A15,A18,A19,A2,A21,A25,A4,A5,A6,A7,B103,B104,B11,B111,B112,B115,B117,B118,B119,B121,B122,B125,B128,B129,B13,B135,B136,B138,B139,B16,B18,B19,B20,B25,B29,B3,B30,B32,B33,B35,B36,B37,B41,B42,B43,B44,B45,B50,B51,B54,B55,B57,B60,B69,B7,B70,B71,B72,B75,B76,B78,B83,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B92,B94,B95,B98,C10,C12,C18,C2,C20,C23,C24,C28,C29,C30,C31,C32,C33,C35,C36,C38,C39,C4,C42,C47,C49,C54,C57,C58,C59,C6,C61,C62,C64,C66,C68,C70,C73,C74,C76,C77,C82,C86,C87,C9,D11,D2,D4,D5,D6,D8
`Chr3:56969998`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr3:56970007`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	66	A10,A11,A2,A20,A22,A23,A24,A3,A6,A8,B101,B102,B103,B106,B112,B113,B114,B120,B126,B137,B139,B14,B15,B21,B22,B25,B27,B31,B33,B37,B49,B51,B57,B61,B66,B69,B71,B74,B77,B81,B84,B9,C1,C11,C15,C16,C17,C19,C21,C22,C26,C34,C35,C40,C45,C5,C51,C69,C7,C71,C80,C82,C84,C86,D7,D8
`Chr3:56970058`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	82	A14,A19,A2,A21,A25,A4,A5,A7,B103,B104,B11,B110,B115,B12,B120,B121,B125,B128,B129,B13,B133,B136,B138,B18,B20,B25,B29,B30,B32,B33,B35,B36,B4,B42,B43,B44,B45,B47,B52,B55,B62,B69,B7,B70,B78,B87,B88,B89,B9,B90,B92,B98,C10,C14,C18,C2,C20,C23,C28,C3,C31,C32,C33,C39,C4,C42,C47,C49,C58,C6,C61,C64,C66,C68,C70,C73,C74,C76,C9,D2,D4,D5
`Chr3:56970204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C45,D10,D6
`Chr3:56970288`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	A22,A24,B15,B20,B28,B37,C25,C34,C44
`Chr3:56970376`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	54	A10,A11,A20,A23,A3,A8,B101,B103,B106,B112,B113,B114,B120,B126,B15,B21,B22,B25,B27,B31,B33,B37,B49,B51,B52,B57,B6,B61,B71,B72,B77,B84,B9,C1,C15,C16,C19,C21,C26,C34,C35,C40,C45,C5,C6,C69,C7,C71,C80,C82,C84,C86,D1,D7
`Chr3:56970380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr3:56970398`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798661.1

298 aa

149

298

GUB_WAK_bind

PF13947 GUB_WAK_bind 36-99 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798661.1`	Pfam	`PF13947`	GUB_WAK_bind	Domain	36	99	1.8e-16	61.0	Wall-associated receptor kinase galacturonan-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942678.1
ATGAATAGTGTGGTGTTGTTTACAATCAATGAATCAACAATGATGAAATGTTCATCTCTCTTTATTCTTTTACTACTCTATTCCTTTGGATCTTGCAATGCAAAGTGCAGCCCTTCTGCCTGCGGTATCATTCCCAATATCAGCTCCCCTTTCCGCCTCAAAGGCGACTCCAAAAACTGCGGTGACAGCAGATTTGAATTACGCTGCGAAAACAATGTGACCTCCATCTCTCTCAACTCTCATAAATACTATGTCAAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014640
ATGAATAGTGTGGTGTTGTTTACAATCAATGAATCAACAATGATGAAATGTTCATCTCTCTTTATTCTTTTACTACTCTATTCCTTTGGATCTTGCAATGCAAAGTGCAGCCCTTCTGCCTGCGGTATCATTCCCAATATCAGCTCCCCTTTCCGCCTCAAAGGCGACTCCAAAAACTGCGGTGACAGCAGATTTGAATTACGCTGCGAAAACAATGTGACCTCCATCTCTCTCAACTCTCATAAATACTATGTCAAAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798661.1
MNSVVLFTINESTMMKCSSLFILLLLYSFGSCNAKCSPSACGIIPNISSPFRLKGDSKNCGDSRFELRCENNVTSISLNSHKYYVKAINYHNSTIRLVDASLNNDDICSFPTYSAYHYNFTYAYDYNFLSYNPHPLPYHIPGNAYIYDVIPYPINFVSCPHPLKNSSLLTDCASNPRYSYIKVGHLNASELPHLCGVEVIVMTSWQEFKDLNNVSLSEIHQSLMYGFELTVCPRCGTSSALPMWGTHERCTLTLSYHSYI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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