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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003789`

染色体: Chr03 坐标: 56987902-56990474 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003789`
名称	SmilChr03G003789
描述	rust resistance kinase Lr10-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	56987902 - 56990474 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014644`
GeneID	`131014644`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014644`
原始查询	`SmilChr03G003789`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rust resistance kinase Lr10-like
产物	rust resistance kinase Lr10-like
Arabidopsis	`AT5G38280` (PR5K) PR5-like receptor kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833810] identity=49.5; qcov=1.02; evalue=4.44e-101; confidence=high
Rice	`Os01g0113400` (OsRLCK4) - identity=54; qcov=1; evalue=2.24e-114; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014644

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057798664.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057798664.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798664.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798664.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798664.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:56988249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B95,C43,C79,D11
`Chr3:56988277`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C8
`Chr3:56988325`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B138,C55
`Chr3:56988342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,C70,C75
`Chr3:56988377`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B119,B87
`Chr3:56988377`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B87
`Chr3:56988380`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C73
`Chr3:56988390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr3:56988429`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C73
`Chr3:56988457`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B111,B54,B57,B86,C29,C30
`Chr3:56988482`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,B14,C7,C71
`Chr3:56988524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798664.1

288 aa

144

288

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 5-274 aa PF00069 Pkinase 6-272 aa

XP_057798665.1

288 aa

144

288

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 5-274 aa PF00069 Pkinase 6-272 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798664.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	5	274	5.6e-46	157.7	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057798664.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	6	272	4.1e-45	155.0	Protein kinase domain
`XP_057798665.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	5	274	5.6e-46	157.7	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057798665.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	6	272	4.1e-45	155.0	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942681.1
ACCACTGCGGTTATCAGGAGTTTGAATTAGTCTGCGAAAACAATGTCACCTCCATCTCTCTTAATTCTCATAAATATCATGTCAAAGCCATCAACTACGGCAACTCCACCATCAGGCTGGTTGATCCTTCCGTGAGCAACCTCGACAACTGCTCTTTCCCCACCTCTTCTGCATATCACTATAACTTCACCGATCATAGCCCTTTTCCTTACCGAACCCAGAGATATTTCTATGACTATAGGGATGTAGCATCGCCAATT...

XM_057942682.1
GCGGTTATCAGGAGTTTGAATTAGTCTGCGAAAACAATGTCACCTCCATCTCTCTTAATTCTCATAAATATCATGTCAAAGCCATCAACTACGGCAACTCCACCATCAGGCTGGTTGATCCTTCCGTGAGCAACCTCGACAACTGCTCTTTCCCCACCTCTTCTGCATATCACTATAACTTCACCGATCATAGCCCTTTTCCTTACCGAACCCAGAGATATTTCTATGACTATAGGGATGTAGCATCGCCAATTAATTTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131014644
ATGACCAAATGTTTTCAAGAAAAACTAGGCCAAGGTGGCTATGGTTCTGTTTACAAAGGAAAACTTCGAAGTGGCACTCATGTAGCTGTAAAACTACTCGAAAAATCAGGAACAAATGGGCAAGACTTTATGAATGAAATTGCAACTATTGGAAGGATCCATCATGTGAATGTCGTGAAATTAGTTGGATATTGTGCTGAAAGATCCAAACGCGCCCTTGTATTTGATTTCATGCCCAATGGTTCCTTGGAGAAGTACTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057798664.1
MTKCFQEKLGQGGYGSVYKGKLRSGTHVAVKLLEKSGTNGQDFMNEIATIGRIHHVNVVKLVGYCAERSKRALVFDFMPNGSLEKYLFNQEKIDFLNWDRKFDIAVGVARGIEYLHRGCDIQILHFDIKPHNVLLDDNFIPKISNFGLAKYFSTEKNCVTLTAARGTIGYVAPELINRSIGAVSYKADVYSFGMLLMEMVGLKRDSIGNNGDSSKYFPYWIYDHFNQGTYIEMGNVDENDITRKVVRKMTIVALWCIQMR...

XP_057798665.1
MTKCFQEKLGQGGYGSVYKGKLRSGTHVAVKLLEKSGTNGQDFMNEIATIGRIHHVNVVKLVGYCAERSKRALVFDFMPNGSLEKYLFNQEKIDFLNWDRKFDIAVGVARGIEYLHRGCDIQILHFDIKPHNVLLDDNFIPKISNFGLAKYFSTEKNCVTLTAARGTIGYVAPELINRSIGAVSYKADVYSFGMLLMEMVGLKRDSIGNNGDSSKYFPYWIYDHFNQGTYIEMGNVDENDITRKVVRKMTIVALWCIQMR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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