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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003805`

染色体: Chr03 坐标: 57123220-57124029 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003805`
名称	SmilChr03G003805
描述	uncharacterized SmilChr03G003805
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	57123220 - 57124029 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014661`
GeneID	`131014661`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014661`
原始查询	`SmilChr03G003805`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0113700; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os01g0113700; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os01g0113700` - identity=35.3; qcov=0.676; evalue=1.22e-20; confidence=low
GO	GO:0030247 (polysaccharide binding)
KEGG	-
Pfam	PF13947 (GUB_WAK_bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014661

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057798684.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057798684.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798684.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798684.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798684.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:57123294`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	85	A10,A11,A20,A22,A23,A24,A3,A6,A8,A9,B100,B101,B102,B103,B106,B112,B113,B114,B118,B120,B126,B127,B132,B137,B139,B14,B15,B21,B22,B25,B27,B28,B31,B33,B37,B44,B49,B51,B52,B56,B57,B6,B61,B66,B69,B71,B72,B74,B77,B81,B82,B84,B9,B96,B99,C1,C11,C15,C16,C17,C19,C21,C22,C25,C26,C28,C34,C35,C4,C5,C50,C51,C6,C69,C7,C71,C75,C80,C82,C83,C84,C86,D1,D7,D8
`Chr3:57123314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B123,B14
`Chr3:57123314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B14
`Chr3:57123434`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr3:57123436`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr3:57123494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B75,C45,D10,D11
`Chr3:57123551`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,B91,C16,D7
`Chr3:57123679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr3:57123718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B117,B16,C59,D8
`Chr3:57123771`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B126
`Chr3:57123771`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B126
`Chr3:57123828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798684.1

247 aa

124

247

GUB_WAK_bind

PF13947 GUB_WAK_bind 36-99 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798684.1`	Pfam	`PF13947`	GUB_WAK_bind	Domain	36	99	5.9e-16	59.3	Wall-associated receptor kinase galacturonan-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942701.1
ATGATGATTAATTCGAATTTGGATGATCAGCTCCAATTAAGTGTAACCATGATCACAATTATTTTGATTCTGTCTCTCCTTTTCTTCGAAACTGGTGACGCAAACTGCACTCCATCTGCGTGCGGCATCATCCGCAACATCAGCTCCCCTTTCCGCCTCAAGGGCGATCCCAACCACTGCGGCGATCCCAGATTTGAATTAGCCTGCGAAGACAACGTCACCTTCGTCTATCAAAACTCTCACAAATACTATGTGAAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014661
ATGATGATTAATTCGAATTTGGATGATCAGCTCCAATTAAGTGTAACCATGATCACAATTATTTTGATTCTGTCTCTCCTTTTCTTCGAAACTGGTGACGCAAACTGCACTCCATCTGCGTGCGGCATCATCCGCAACATCAGCTCCCCTTTCCGCCTCAAGGGCGATCCCAACCACTGCGGCGATCCCAGATTTGAATTAGCCTGCGAAGACAACGTCACCTTCGTCTATCAAAACTCTCACAAATACTATGTGAAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798684.1
MMINSNLDDQLQLSVTMITIILILSLLFFETGDANCTPSACGIIRNISSPFRLKGDPNHCGDPRFELACEDNVTFVYQNSHKYYVKEINYGIARIRVVDASINNNSICSFPTYTFITDDESPYRTFSHHSYPYNGYTASPIFFISCPNQLSNSSLFTDITDCASNSSLPTPRYDYIKVGRMEKPSEVPHRCTVDVVAFTSSEFKDSGNVSLSEIHQSLLYGFELYVCSWWWCRRTTSNWGTVMDFHH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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