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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003817`

染色体: Chr03 坐标: 57232905-57233327 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003817`
名称	SmilChr03G003817
描述	uncharacterized SmilChr03G003817
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	57232905 - 57233327 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019050`
GeneID	`131019050`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019050`
原始查询	`SmilChr03G003817`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019050

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803715.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803715.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057803715.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803715.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803715.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:57233022`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B132
`Chr3:57233054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B90,C14
`Chr3:57233112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B135,C33
`Chr3:57233120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A1,B11,B133,B75,C75
`Chr3:57233120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B11,B133,B75,C75
`Chr3:57233146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:57233192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,C45,C80
`Chr3:57233214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B77,C69,C84
`Chr3:57233232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr3:57233321`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,C85
`Chr3:57233324`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C29
`Chr3:57233324`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803715.1

140 aa

140

RVT_3

PF13456 RVT_3 3-109 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803715.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	3	109	9.6e-12	45.6	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947732.1
ATGCATGCGGGTGGTGTGGTCAGAAATGCCTTTAATTCGGTGGTGGCGTGCTTTCAATTTTCGGCAGGAGCCGGTTTTGCCTTTGAGGCGGAACTTTTTTCTTTTATTATCATTCTTGAGAGGGCTGCTGCTCATCAATGGTATAACCTCTGGATTGAATCTGATTCAACATACGTTGTGAATGTCTTCAATAATCGTGAGGTTCCGGTCCCGTGGCGTTTTCGGAGCAGATGGCAGGCGGCGCTTAAAGGTGTGGAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019050
ATGCATGCGGGTGGTGTGGTCAGAAATGCCTTTAATTCGGTGGTGGCGTGCTTTCAATTTTCGGCAGGAGCCGGTTTTGCCTTTGAGGCGGAACTTTTTTCTTTTATTATCATTCTTGAGAGGGCTGCTGCTCATCAATGGTATAACCTCTGGATTGAATCTGATTCAACATACGTTGTGAATGTCTTCAATAATCGTGAGGTTCCGGTCCCGTGGCGTTTTCGGAGCAGATGGCAGGCGGCGCTTAAAGGTGTGGAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803715.1
MHAGGVVRNAFNSVVACFQFSAGAGFAFEAELFSFIIILERAAAHQWYNLWIESDSTYVVNVFNNREVPVPWRFRSRWQAALKGVEHYNLRCSHNYREGNHVADYLASSHSQEGFWLHSIPEIAQLVSDDVHSSFVRMVR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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