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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003818`

染色体: Chr03 坐标: 57249431-57253624 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003818`
名称	SmilChr03G003818
描述	uncharacterized SmilChr03G003818
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	57249431 - 57253624 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014680`
GeneID	`131014680`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014680`
原始查询	`SmilChr03G003818`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0219100; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0219100; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G24170` (AT5G24170) Got1/Sft2-like vescicle transport protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832484] identity=71.3; qcov=0.917; evalue=1.41e-72; confidence=high
Rice	`Os01g0219100` - identity=73.7; qcov=0.974; evalue=8.07e-80; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0016192 (vesicle-mediated transport)
KEGG	-
Pfam	PF04178 (Got1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014680

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057798715.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.80000	`XP_057798715.1`
3	Secretory vesicle	Secretory vesicle	0.40000	`XP_057798715.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057798715.1`
5	Vesicle	囊泡	0.40000	`XP_057798715.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:57249771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr3:57252158`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B24
`Chr3:57252196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:57253133`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C54
`Chr3:57253133`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C54
`Chr3:57253180`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B29,B4,B76,B78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798715.1

156 aa

156

Got1

PF04178 Got1 31-138 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798715.1`	Pfam	`PF04178`	Got1	Family	31	138	1e-32	113.7	Got1/Sft2-like family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942732.1
TACTCCACTTATTTCCGTTTAACAGTAGTAGCTAATTAGTCACGTCTTTTTTTAAAAAAATATATCATTGAATATTTTTATGTGCATTCTTTTATTTACTTCACCACTTGAAAATTTATTGTTTTGCAATTAGTTTTACATCTATAATACATTTATTAAAGCAACGAAAAATATACTACAAGTCTCGTGAAATATATCAATAACTATAAAATATACTACTAGGATTTGATCACATATTATTATTAGAAAAATAAAGTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014680
ATGTGGAATTCTACCCAAGATGATGAAGAACAGCAAGATTACTTTCTTGAAGGGACCGAAGGTCTCTGCTCTCTCTCTCCTATGCAGAGGATTTATGGATTCGGTGCTTGTTTACTAGCTGGGGTTGTTTGTATGTTCTTGTCATTGATTGTTTTCGCGATGCCCATCAAATTCGCGCTATTATTTACCTTTGGCAATGTGCTGGCAGTTGGGAGCACAGCTTTCGTCATTGGACCCAGGCAACAGCTCAACATGATGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798715.1
MWNSTQDDEEQQDYFLEGTEGLCSLSPMQRIYGFGACLLAGVVCMFLSLIVFAMPIKFALLFTFGNVLAVGSTAFVIGPRQQLNMMLDDVRVYATAVYGGCVIVALVCGLLIHSKILTLIAVICEICALFWYSLSYIPFARRMVSDLTIRLCDTEI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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