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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003823`

染色体: Chr03 坐标: 57274381-57277409 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003823`
名称	SmilChr03G003823
描述	uncharacterized SmilChr03G003823
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	57274381 - 57277409 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014679`
GeneID	`131014679`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014679`
原始查询	`SmilChr03G003823`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CCT motif family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835423]; symbol=AT5G53420; hit=AT5G53420; species=arabidopsis; confidence=high
产物	CCT motif family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835423]; symbol=AT5G53420; hit=AT5G53420; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G53420` (AT5G53420) CCT motif family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835423] identity=51.4; qcov=0.953; evalue=7.23e-74; confidence=high
Rice	`Os05g0595300` (CRCT) - identity=51.3; qcov=1.02; evalue=1.05e-73; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0009909 (regulation of flower development)
KEGG	-
Pfam	PF06203 (CCT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014679

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798708.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057798709.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057798709.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798711.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798711.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:57274642`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr3:57274668`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	A10,B1,B19,B23,B24,B48,B7,C1,C78
`Chr3:57274708`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B135,B19,C38,C62
`Chr3:57275832`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B100,C48
`Chr3:57275832`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B100,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798710.1

283 aa

142

283

CCT

PF06203 CCT 232-274 aa

XP_057798711.1

286 aa

143

286

CCT

PF06203 CCT 235-277 aa

XP_057798714.1

257 aa

128

257

CCT

PF06203 CCT 206-248 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798710.1`	Pfam	`PF06203`	CCT	Motif	232	274	2.4e-17	63.4	CCT motif
`XP_057798711.1`	Pfam	`PF06203`	CCT	Motif	235	277	2.5e-17	63.4	CCT motif
`XP_057798714.1`	Pfam	`PF06203`	CCT	Motif	206	248	1.9e-17	63.7	CCT motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942728.1
AATGGAGTAGTAATAAAAATTTCACCCTCTTTTTAACTGGCAAAATTCTGTCCTAAATGAAAGACGCCAAACATCCAACCAAAATCAGATTCCTCTCTTTCCCACTCTCTCTCTCTCTCTATAACACGGCTGCTGCTCCTGCTACTCTGTTTTCTACTGTGTCGACACCTATAAGAGGCCACCTCCCTCCATTGAACACTTCTCTTATATTTTTACGTACACTTAGATACAGACCTACGTCTCTCTCTCTCTCATCTTTG...

XM_057942725.1
CTTTTTAACTGGCAAAATTCTGTCCTAAATGAAAGACGCCAAACATCCAACCAAAATCAGATTCCTCTCTTTCCCACTCTCTCTCTCTCTCTATAACACGGCTGCTGCTCCTGCTACTCTGTTTTCTACTGTGTCGACACCTATAAGAGGCCACCTCCCTCCATTGAACACTTCTCTTATATTTTTACGTACACTTAGATACAGACCTACGTCTCTCTCTCTCTCATCTTTGATATAAAAAGGTAGAAAGAGAAGAGAAG...

CDS

6 records

下载 CDS FASTA

LOC131014679
ATGTATGCAGGGCTAATGTACCCTTACTTCCATAACTTCACTCAAGAAGTTCAGCACTTTGAAGACTTTGGCTGCTCTCAGAAGCCCAATGCTTCATCGGGCACACCAAGCAGCGTCGTTCAGGCGTCTGCTGTATCTGATTACAGCCTGTGGGGCGAAGGAGATCTGTTTAATGCACCTGAACCGGTTATCGAGGAGCCCGTTGTGGGACTTGATCCGATGACCGTTGCCATCTCAATGATCTCTTGTGGAGAAGATGT...

LOC131014679
ATGATGAAAATGGGCACACCAAGCAGCGTCGTTCAGGCGTCTGCTGTATCTGATTACAGCCTGTGGGGCGAAGGAGATCTGTTTAATGCACCTGAACCGGTTATCGAGGAGCCCGTTGTGGGACTTGATCCGATGACCGTTGCCATCTCAATGATCTCTTGTGGAGAAGATGTCATCTCCCCTCAGTCGCTGAGTGTGTCGGATATTGAGTCATCGATTGAGAGTGGGCAGCTCCTAAGCGAGGTTTTCTACGAGTGCAG...

Protein

6 records

下载 Protein FASTA

XP_057798708.1
MYAGLMYPYFHNFTQEVQHFEDFGCSQKPNASSGTPSSVVQASAVSDYSLWGEGDLFNAPEPVIEEPVVGLDPMTVAISMISCGEDVISPQSLSVSDIESSIESGQLLSEVFYECRKDILAKEGNETPLSEVLSINIPTHVKVDENMMIDEKSDAECLFQKSVSSSCLRSMDNVHETPLRPSFLDFPVDDFEAAYGMRRAYSEGDIKALCNGTINHVQSPMGQPRVLSSCISEVRREKLSRYWSKKSKRNFGRKIKVNIK...

XP_057798709.1
MIMFCGYSDTENVVHFGEMFDYVVIIVHIPGTPSSVVQASAVSDYSLWGEGDLFNAPEPVIEEPVVGLDPMTVAISMISCGEDVISPQSLSVSDIESSIESGQLLSEVFYECRKDILAKEGNETPLSEVLSINIPTHVKVDENMMIDEKSDAECLFQKSVSSSCLRSMDNVHETPLRPSFLDFPVDDFEAAYGMRRAYSEGDIKALCNGTINHVQSPMGQPRVLSSCISEVRREKLSRYWSKKSKRNFGRKIKVNIKALL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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