当前解析结果
SmilChr03G003826| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003826 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003826 |
| 描述 | wax ester synthase/diacylglycerol acyltransferase 11-like |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 57363154 - 57365415 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131014702 |
|---|---|
| GeneID | 131014702 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131014702 |
| 原始查询 | SmilChr03G003826 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | wax ester synthase/diacylglycerol acyltransferase 11-like |
| 产物 | wax ester synthase/diacylglycerol acyltransferase 11-like |
| Arabidopsis | AT5G53390 (FOP1)O-acyltransferase (WSD1-like) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835420] identity=46.2; qcov=0.994; evalue=8.81e-150; confidence=high |
| Rice | Os05g0556300- identity=42.2; qcov=0.99; evalue=4.56e-131; confidence=medium |
| GO | GO:0004144 (diacylglycerol O-acyltransferase activity); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0019432 (triglyceride biosynthetic process); GO:0047196 (long-chain-alcohol O-fatty-acyltransferase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF03007 (WS_DGAT_cat); PF06974 (WS_DGAT_C) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131014702 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057798740.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 1.00000 | XP_057798740.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057798740.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057798740.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057798740.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:57363979 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr3:57364624 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A21 |
Chr3:57364852 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C85 |
Chr3:57364972 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B131,B42,B43,C64,C66 |
Chr3:57365344 |
TTC |
* |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | B126 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057798740.1PF03007
WS_DGAT_cat 64-262 aa
PF06974
WS_DGAT_C 332-476 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057798740.1 |
Pfam | PF03007 |
WS_DGAT_cat | Domain | 64 | 262 | 6.4e-18 | 66.2 | Wax ester synthase/diacylglycerol acyltransferase catalytic domain |
XP_057798740.1 |
Pfam | PF06974 |
WS_DGAT_C | Domain | 332 | 476 | 1.8e-47 | 161.8 | WS/DGAT C-terminal domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。