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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003829`

染色体: Chr03 坐标: 57391373-57396027 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003829`
名称	SmilChr03G003829
描述	2-methylpropanoate--CoA ligase CCL4-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	57391373 - 57396027 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014694`
GeneID	`131014694`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014694`
原始查询	`SmilChr03G003829`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	2-methylpropanoate--CoA ligase CCL4-like
产物	2-methylpropanoate--CoA ligase CCL4-like
Arabidopsis	`AT1G21530` (AT1G21530) AMP-dependent synthetase and ligase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838754] identity=59.2; qcov=0.901; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0674700` - identity=58.9; qcov=0.906; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00501 (AMP-binding); PF13193 (AMP-binding_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014694

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057798729.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057798729.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798729.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798729.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798729.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:57391486`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B35,B50,B60,C38,C40
`Chr3:57391510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,C49
`Chr3:57391659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B93
`Chr3:57391684`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr3:57391699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B139,B5,C58
`Chr3:57391951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr3:57394920`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr3:57394956`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr3:57394957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,C26
`Chr3:57395012`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B40,C13,C54,D3
`Chr3:57395023`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A19
`Chr3:57395023`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798729.1

596 aa

298

596

AMP-binding

AMP-binding_C

PF00501 AMP-binding 78-455 aa PF13193 AMP-binding_C 506-583 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798729.1`	Pfam	`PF00501`	AMP-binding	Family	78	455	7.2e-73	246.3	AMP-binding enzyme
`XP_057798729.1`	Pfam	`PF13193`	AMP-binding_C	Domain	506	583	8.6e-23	81.8	AMP-binding enzyme C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942746.1
AAAGTCGCTGCGTAAATCATGAACACAACTCTCACACACACACACTTACAGTTGAGACCCTTCTCTTCTTGCCATTCATTCCCACAATTCATACCGCCTCTTTCACGGCGGCAACCGCCACGCGCACCCAAACAACGTACAACCCATGCTTCAATATCACTGCCTCTCATCTCCAACAACTCAACGCCTCTCCCTCCCGAACATGCCAACGTACAACCAACAACTGCTCTAACTCCTCTCAACTTTCTTGAAAGAGCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014694
ATGAACACAACTCTCACACACACACACTTACAGTTGAGACCCTTCTCTTCTTGCCATTCATTCCCACAATTCATACCGCCTCTTTCACGGCGGCAACCGCCACGCGCACCCAAACAACGTACAACCCATGCTTCAATATCACTGCCTCTCATCTCCAACAACTCAACGCCTCTCCCTCCCGAACATGCCAACGTACAACCAACAACTGCTCTAACTCCTCTCAACTTTCTTGAAAGAGCCGCCCTCATCTACGGCGACTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798729.1
MNTTLTHTHLQLRPFSSCHSFPQFIPPLSRRQPPRAPKQRTTHASISLPLISNNSTPLPPEHANVQPTTALTPLNFLERAALIYGDFPSIIYNGITRTWAETRIRCLKLASSIAALGISRGDVVSVVAPNIPAMCELHFAVPMAAAVLNAISLRLNANAVSNLLRHGDSKLVFVDSESASLVREAVSLLPPHHRRPILVLIGDDGCEERSSFDLDYESMVENGDAAFEWVRPRSEWDPIVLNYTSGTTAAPKGVVHSHRS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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