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Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr03G003831

染色体: Chr03 坐标: 57410418-57417373 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr03G003831
名称SmilChr03G003831
描述wax ester synthase/diacylglycerol acyltransferase 11-like
染色体 / SeqIDChr03 / NC_080389.1
坐标与链方向57410418 - 57417373 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131014700
GeneID131014700
locus_tag-
NCBI NameLOC131014700
原始查询SmilChr03G003831

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述wax ester synthase/diacylglycerol acyltransferase 11-like
产物wax ester synthase/diacylglycerol acyltransferase 11-like
ArabidopsisAT5G53390 (FOP1)
O-acyltransferase (WSD1-like) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835420]
identity=46.8; qcov=0.954; evalue=6.35e-153; confidence=high
RiceOs05g0556300
-
identity=41; qcov=0.948; evalue=1.33e-125; confidence=medium
GOGO:0004144 (diacylglycerol O-acyltransferase activity); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0019432 (triglyceride biosynthetic process); GO:0047196 (long-chain-alcohol O-fatty-acyltransferase activity)
KEGG-
PfamPF03007 (WS_DGAT_cat); PF06974 (WS_DGAT_C)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131014700

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Endoplasmic reticulum 内质网 1.00000 XP_057798738.1
2 Endoplasmic reticulum membrane 内质网膜 1.00000 XP_057798738.1
3 Nucleus 细胞核 0.00000 XP_057798738.1
4 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057798738.1
5 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057798738.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr3:57410621 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C40
Chr3:57410650 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 D10
Chr3:57410818 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B78
Chr3:57410883 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 A16,B136,B26,B59,C52
Chr3:57410908 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C48
Chr3:57410997 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 A16,B136,B59,C52
Chr3:57411045 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 A22,C49
Chr3:57411196 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 A18,B109,B133,C29
Chr3:57411298 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 C28,C75
Chr3:57411338 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B136,C8
Chr3:57411521 TC T 1bp_deletion frameshift_variant 1 C76
Chr3:57411521 TC T 1bp_deletion CDS_variant 1 C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798738.1
504 aa
N
1
252
504
WS_DGAT_cat
WS_DGAT_C
C
PF03007 WS_DGAT_cat 74-267 aa PF06974 WS_DGAT_C 337-481 aa
XP_057798739.1
504 aa
N
1
252
504
WS_DGAT_cat
WS_DGAT_C
C
PF03007 WS_DGAT_cat 74-267 aa PF06974 WS_DGAT_C 337-481 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057798738.1 Pfam PF03007 WS_DGAT_cat Domain 74 267 1.7e-16 61.5 Wax ester synthase/diacylglycerol acyltransferase catalytic domain
XP_057798738.1 Pfam PF06974 WS_DGAT_C Domain 337 481 1e-44 152.8 WS/DGAT C-terminal domain
XP_057798739.1 Pfam PF03007 WS_DGAT_cat Domain 74 267 1.7e-16 61.5 Wax ester synthase/diacylglycerol acyltransferase catalytic domain
XP_057798739.1 Pfam PF06974 WS_DGAT_C Domain 337 481 1e-44 152.8 WS/DGAT C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA
XM_057942755.1
TAGTCAGAACAAATTCGAATACTAGTCGTGGACGCTATCTAGCTATTTATATTCGAAATACATAGCTAGCTAATTTTATAATTTTCATTTTCATTAACAATGAAAATCTCCGACAGTAAATCAATGGCGAAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGAGGAGCCCGTGAGTCCGACTGGGCGAATGATGCAGGCACCAAAATTCAATCTCTTCATAATAATATTAATGGGTTATAATACAAAAATCGAGCCCTCATTATACAAGAA...
XM_057942756.1
TAGTCAGAACAAATTCGAATACTAGTCGTGGACGCTATCTAGCTATTTATATTCGAAATACATAGCTAGCTAATTTTATAATTTTCATTTTCATTAACAATGAAAATCTCCGACAGTAAATCAATGGCGAAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGAGGAGCCCGTGAGTCCGACTGGGCGAATGATGCAGGCACCAAAATTCAATCTCTTCATAATAATATTAATGGGTTATAATACAAAAATCGAGCCCTCATTATACAAGAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA
LOC131014700
ATGAAAATCTCCGACAGTAAATCAATGGCGAAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGAGGAGCCCGTGAGTCCGACTGGGCGAATGATGCAGGCACCAAAATTCAATCTCTTCATAATAATATTAATGGGTTATAATACAAAAATCGAGCCCTCATTATACAAGAAGTGCATGCAGCAAACCTTGCTCAAGCACCCTCGTTTCTCCAGCACTCTCGTGGCGAGCGGCGGCAGGTTCCGGTGGAGACGGACGGCGGTGGACATCGA...
LOC131014700
ATGAAAATCTCCGACAGTAAATCAATGGCGAAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGAGGAGCCCGTGAGTCCGACTGGGCGAATGATGCAGGCACCAAAATTCAATCTCTTCATAATAATATTAATGGGTTATAATACAAAAATCGAGCCCTCATTATACAAGAAGTGCATGCAGCAAACCTTGCTCAAGCACCCTCGTTTCTCCAGCACTCTCGTGGCGAGCGGCGGCAGGTTCCGGTGGAGACGGACGGCGGTGGACATCGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA
XP_057798738.1
MKISDSKSMAKEEEEEEEEPVSPTGRMMQAPKFNLFIIILMGYNTKIEPSLYKKCMQQTLLKHPRFSSTLVASGGRFRWRRTAVDIDSHVFVPEVGPAAVESPDEFVADYASSLSEIPMDTAKPLWEFHILNVKTSDAEAVVVMKIHHSLGDGVSLIALTHACSRKIHDPDSLPVLPASNNPRKGGSGGAAMRLLKAVWTVVLILFYTLVDMTAFVATLLFLRDVQTPVRAGRGVKLCRKRFVHRIVSLDDVKLIKNAMN...
XP_057798739.1
MKISDSKSMAKEEEEEEEEPVSPTGRMMQAPKFNLFIIILMGYNTKIEPSLYKKCMQQTLLKHPRFSSTLVASGGRFRWRRTAVDIDSHVFVPEVGPAAVESPDEFVADYASSLSEIPMDTAKPLWEFHILNVKTSDAEAVVVMKIHHSLGDGVSLIALTHACSRKIHDPDSLPVLPASNNPRKGGSGGAAMRLLKAVWTVVLILFYTLVDMTAFVATLLFLRDVQTPVRAGRGVKLCRKRFVHRIVSLDDVKLIKNAMN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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