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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003834`

染色体: Chr03 坐标: 57481259-57486590 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003834`
名称	SmilChr03G003834
描述	uncharacterized SmilChr03G003834
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	57481259 - 57486590 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014687`
GeneID	`131014687`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014687`
原始查询	`SmilChr03G003834`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	prolyl oligopeptidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832493]; symbol=AT5G24260; hit=AT5G24260; species=arabidopsis; confidence=high
产物	prolyl oligopeptidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832493]; symbol=AT5G24260; hit=AT5G24260; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G24260` (AT5G24260) prolyl oligopeptidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832493] identity=67.6; qcov=0.962; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0290600` (OsPOP5) - identity=70.2; qcov=0.773; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008236 (serine-type peptidase activity); GO:0008239 (dipeptidyl-peptidase activity)
KEGG	smil03272 (Virion - Hepatitis viruses - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00326 (Peptidase_S9); PF00930 (DPPIV_N); PF02129 (Peptidase_S15)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014687

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798721.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057798721.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798721.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798721.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798721.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:57482115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr3:57482478`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr3:57482532`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr3:57482651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B32,C25,C5
`Chr3:57482711`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:57482917`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B133
`Chr3:57483099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B105,C71
`Chr3:57483367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B105
`Chr3:57483369`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B2,B74,C79
`Chr3:57484514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr3:57484666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,C13,C54
`Chr3:57485239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798721.1

770 aa

385

770

DPPIV_N

Peptidase_S9

Peptidase_S15

PF00930 DPPIV_N 158-484 aa PF00326 Peptidase_S9 571-769 aa PF02129 Peptidase_S15 578-671 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798721.1`	Pfam	`PF00930`	DPPIV_N	Repeat	158	484	5.6e-84	282.6	Dipeptidyl peptidase IV (DPP IV) N-terminal region
`XP_057798721.1`	Pfam	`PF00326`	Peptidase_S9	Domain	571	769	5.2e-55	187.0	Prolyl oligopeptidase family
`XP_057798721.1`	Pfam	`PF02129`	Peptidase_S15	Domain	578	671	1.1e-10	42.4	X-Pro dipeptidyl-peptidase (S15 family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942738.1
ACAATAACCAGATAATTTATTGCATAAAAAACACTCCAGCTAGATTAACTCCGCCACCAGAACAAACCCACGCGCCACTCCTCCCACAAAAACTGACTTATCACACACCATCTATTCACTCTCACATCAAATCATTTCAAACCCTTTTGGTTTCTGAATTTACTCCGAAATTATCAGAGTTTCTGATAAATCTGCGTTTAAGTGTTGATTTAATCAGTATTTATTGGAAGGAATCCCGAATCCGAATCCGATTCCGATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014687
ATGCAATCACTGATTGAGAGTGGCAAAAAGAAGAATCTCAAACGTTCGTGGTTCGAAATGCCTGTAACTGACACAACTGTTGCAAATGCGCTGGACAATTGCACTATATTTCCTGTTGAAGAGATAGCACAGCATCCTTTACCAGGTTATGGAGTGCCAACTGCAATTAGTTTTAGCCTCGATGATTGTCTCATAGCATACTTGTTCAGTCAGGATCAGACTTTGAACAGGAACTTGTTTGTATTTGATCCCAAGAGTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798721.1
MQSLIESGKKKNLKRSWFEMPVTDTTVANALDNCTIFPVEEIAQHPLPGYGVPTAISFSLDDCLIAYLFSQDQTLNRNLFVFDPKSGKHDLFFSPPDGGLDENNVSAEEKLRRERLRERGLGVTRYEWVKTSPRRKRLIVPLPAGIYSQENDDKTELLIPSASGSPIIDPHLSPDGTRLAYVRDNELHVSSLLYNVSKQLTVGANENAITHGLAEFIAQEEMDRKNGYWWSLDSKFIAFTEVDSSEVPLYRIMHQGKSSV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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