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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr03G003838

染色体: Chr03 坐标: 57523799-57526567 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr03G003838
名称SmilChr03G003838
描述hsp70 nucleotide exchange factor FES1-like
染色体 / SeqIDChr03 / NC_080389.1
坐标与链方向57523799 - 57526567 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131014709
GeneID131014709
locus_tag-
NCBI NameLOC131014709
原始查询SmilChr03G003838

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述hsp70 nucleotide exchange factor FES1-like
产物hsp70 nucleotide exchange factor FES1-like
ArabidopsisAT3G09350 (Fes1A)
Fes1A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820091]
identity=70.1; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
RiceOs03g0822700 (OSJNBb0081B07.19)
-
identity=68.1; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GOGO:0005515 (protein binding)
KEGGsmil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
PfamPF08609 (Fes1); PF28415 (SIL1_FES1_HPBP1_C)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131014709

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Cytoplasm 细胞质 1.00000 XP_057798757.1
2 Cytosol 细胞质基质 1.00000 XP_057798757.1
3 Nucleus 细胞核 0.60000 XP_057798757.1
4 Nucleoplasm 核质 0.20000 XP_057798757.1
5 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057798757.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798757.1
371 aa
N
1
186
371
Fes1
SIL1_FES1_HPBP1_C
C
PF08609 Fes1 9-95 aa PF28415 SIL1_FES1_HPBP1_C 91-216 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057798757.1 Pfam PF08609 Fes1 Repeat 9 95 2.3e-12 48.5 Nucleotide exchange factor Fes1
XP_057798757.1 Pfam PF28415 SIL1_FES1_HPBP1_C Repeat 91 216 7.3e-16 59.1 SIL1/FES1/HPBP1 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057942774.1
ATAATAATAATAATAATAATCTTCTTAATAAGATCTATTTTCCGTTTTTCTGAAGAGAAAACCTAGACATCAAGTCTTATTAAGTTACCGCGAGGATAATTATTCTTATTAACTGGGAATTAGGGACCTATGACCTATCACATCCTAATAATATCAATAAGACCCATATGAATCATAGGATCGAAAATCTGGGGTATTACATTAATAATGAAAATTAGTTTATTTGTTTAGAAGATGGAACATTCTTTAAAAAAAAAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC131014709
ATGGCAAGAGAAGGCCCTAATTGGGAAGGATTGCTTAAGTGGAGTCTTTCCCACGCCGACGGTACTAACACTTCTCGCAGTTTGAGTGAGGAGGATAGAAGATGGTTTATGGAGGCGATGCAAGGGCAGACAATTGATGTTATTAAGCGAATGAAGGAGATAACACTTGTTATGAAGACCCCTGAGCAGGTTTTGGAGTCTCAGGGGGTGACTCCTCAAGATATTGAAGATATGTTGGATGAGCTACAAGAACAAGTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057798757.1
MAREGPNWEGLLKWSLSHADGTNTSRSLSEEDRRWFMEAMQGQTIDVIKRMKEITLVMKTPEQVLESQGVTPQDIEDMLDELQEQVESIDNANDLHSIGGLAPLLDYLRNPHANIRAKAADVVSTVVQNNPRSQQLVMEANGMEPLLSNFTSDPDVGVRTKALGAISSLIRHNKPGIAAFRLANGYAALRDALGSESVRFQRKALNLIHYLLSENHSDINVISELGFPRIMMHLASSEDSDVREAALRSLLDLARDRSEK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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