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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003848`

染色体: Chr03 坐标: 57581096-57586565 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003848`
名称	SmilChr03G003848
描述	putative WEB family protein At1g65010, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	57581096 - 57586565 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014686`
GeneID	`131014686`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014686`
原始查询	`SmilChr03G003848`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative WEB family protein At1g65010, chloroplastic
产物	putative WEB family protein At1g65010%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G53020` (AT5G53020) Ribonuclease P protein subunit P38-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835381] identity=39.9; qcov=0.949; evalue=2.83e-139; confidence=medium
Rice	`Os03g0853600` - identity=35.3; qcov=0.232; evalue=4.41e-24; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF28715 (DUF8445)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014686

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057798719.1`
2	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057798719.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057798719.1`
4	Cytoskeleton	细胞骨架	0.20000	`XP_057798719.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798719.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:57582248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:57582261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,B64,C27
`Chr3:57582285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,B60
`Chr3:57582399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr3:57582856`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr3:57583050`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B40,B90,B92,D3,D4
`Chr3:57583106`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B40
`Chr3:57583107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr3:57584318`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798719.1

806 aa

403

806

DUF8445

PF28715 DUF8445 621-802 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798719.1`	Pfam	`PF28715`	DUF8445	Repeat	621	802	1.5e-52	178.7	Domain of unknown function (DUF8445)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XR_009098303.1
TCCATACTATAATCTTGAAACTGATGTTGGTGGATTCTATTTCTCATCTTCTTGGAAAACAGTGTAGCATAGGAATGTTGAAATTTGATGGAAGGTGGAATAAGAGAATAATCATAGCAATGATGAGAAAATATTCTGTGGGAATCAGAGACGTATATATGTATTCACATTCAAGTTTAAATCCATGTTGTGGGGACACAGATTGACAGCCAAGCCAAGCTGGAAAGATGAGAATGCACATAAGTGTTTGTTAATTTGCC...

XR_009098300.1
TCCATACTATAATCTTGAAACTGATGTTGGTGGATTCTATTTCTCATCTTCTTGGAAAACAGTGTAGCATAGGAATGTTGAAATTTGATGGAAGGTGGAATAAGAGAATAATCATAGCAATGATGAGAAAATATTCTGTGGGAATCAGAGACGTATATATGTATTCACATTCAAGTTTAAATCCATGTTGTGGGGACACAGATTGACAGCCAAGCCAAGCTGGAAAGATGAGAATGCACATAAGTGTTTGTTAATTTGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014686
ATGGATGAAAAGGGAATGTCAGGTTCCATCACTGTGGGATCCGAGGATAGTATCGATACATTGTATCCAATGTTGTTTGGTGTTTCTTGTGCATTTTTCGCTCTAAGACTGCTGCCGGAGCAGCCTGAATTATGTGATGATATGTGGTCACAAGTCACAGCTAGAATGCTTCAAGGGAGTAGTCATCTTCTAGGGTTACTCGTGTGGAGGGTTCAGAGGGACGAGGCGAAAAGTAGAAACACCGAGCTTCTGAAGAAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798719.1
MDEKGMSGSITVGSEDSIDTLYPMLFGVSCAFFALRLLPEQPELCDDMWSQVTARMLQGSSHLLGLLVWRVQRDEAKSRNTELLKKLEDAEKQVQELKKRRSEDARANEKVVRIVATREQSWSDERKKLRQQIGGLMNDLRVVKMKSERSIAELNQKLKENEAIMHLKDKSIEEVELKRVEIDEKVNKAENLLKEMRENAQREAQRHASETLKHKTAFIELVSSQRQLEAEMSRAVRQVEVAKQELDSVLDQKEQAVLMT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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