当前解析结果
SmilChr03G003851| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003851 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003851 |
| 描述 | protein ABIL3 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 57633720 - 57637407 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131014718 |
|---|---|
| GeneID | 131014718 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131014718 |
| 原始查询 | SmilChr03G003851 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein ABIL3 |
| 产物 | protein ABIL3 |
| Arabidopsis | AT5G24310 (ABIL3)ABL interactor-like protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832498] identity=66.1; qcov=1; evalue=6.26e-147; confidence=high |
| Rice | Os01g0551800- identity=43.3; qcov=0.985; evalue=2.22e-71; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF27594 (ABI) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131014718 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoskeleton | 细胞骨架 | 1.00000 | XP_057798769.1 |
| 2 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.20000 | XP_057798769.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057798769.1 |
| 4 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.20000 | XP_057798769.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057798769.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:57635125 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr3:57636438 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B12,B35,B55,D3 |
Chr3:57636707 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C48 |
Chr3:57636729 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A8 |
Chr3:57636869 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B77 |
Chr3:57636906 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B12,B35,B55,D3 |
Chr3:57636930 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B114 |
Chr3:57637204 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057798769.1PF27594
ABI 25-96 aa
XP_057798770.1PF27594
ABI 25-96 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057798769.1 |
Pfam | PF27594 |
ABI | Domain | 25 | 96 | 3.8e-16 | 59.6 | Abl interactor protein |
XP_057798770.1 |
Pfam | PF27594 |
ABI | Domain | 25 | 96 | 3.8e-16 | 59.6 | Abl interactor protein |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。