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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003855`

染色体: Chr03 坐标: 57651471-57653921 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003855`
名称	SmilChr03G003855
描述	50S ribosomal protein L17, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	57651471 - 57653921 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014728`
GeneID	`131014728`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014728`
原始查询	`SmilChr03G003855`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	50S ribosomal protein L17, chloroplastic
产物	50S ribosomal protein L17%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G54210` (AT3G54210) Ribosomal protein L17 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824588] identity=71.1; qcov=0.985; evalue=8.16e-91; confidence=high
Rice	`Os03g0815400` - identity=66.8; qcov=1.02; evalue=3.3e-83; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01196 (Ribosomal_L17)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014728

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057798791.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798791.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798791.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798791.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798791.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:57651631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B56,B96,C50,C83
`Chr3:57651694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B101,C38
`Chr3:57651696`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B51,B68,B9
`Chr3:57651775`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B117,B46,C7
`Chr3:57651796`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:57651927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B66,C30,D1
`Chr3:57652914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:57652969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr3:57652973`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798791.1

197 aa

197

Ribosomal_L17

PF01196 Ribosomal_L17 101-197 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798791.1`	Pfam	`PF01196`	Ribosomal_L17	Family	101	197	5.7e-37	127.2	Ribosomal protein L17

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942808.1
GGGGTTCGAACCCAGGACCTCATTGTTCACACACAAGAGGTCGCACCGCTTGGTGTCCTCTTGGGGACATTCACTCATTCATTTAAGATTTATAATTATTTTTTATTTATTTTTAAAACTTTAAAGTAATAATTAATTTAAAGTTTATATTATATATTTTTTTTATAATTTCAATGTTTAGTAAAAAATATTAATTTAGAATTCATTATATAATAACATTTTATTTTTAAAAATAAATAATTATAAAATAGTGAAATTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014728
ATGGCGTCTGCTTCAACGTTTAGCCTCTCTTCTCTACGTGCCGCTCTCCCCTCCCCTCCTTCTATTTGCTTTCCTAACGGGCCCTCTTCTTCAAAGCTCAGACTCTCTCGCCCTAAGCCCGGCCCGAGGCCGCTCAACTCCTTTGTCGGTCTCGCTCCCTTGCACCCCATCTTCTCTTCTCCAGATTCATTCAGTTTTGAGTTCTGTTTTCCCACACTCGACAATGGTGGGCGTTTCTTTGCCATGAGACACGGGAGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798791.1
MASASTFSLSSLRAALPSPPSICFPNGPSSSKLRLSRPKPGPRPLNSFVGLAPLHPIFSSPDSFSFEFCFPTLDNGGRFFAMRHGRKVPKLNRPPDQRKALLRGLTTQLLKYGRIKTTRARASAMRKYVDKMVTLAKDGTLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVGERYGDREGGYTRIIRTLPRRGDNAPMAYIELV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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