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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003858`

染色体: Chr03 坐标: 57672997-57674764 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003858`
名称	SmilChr03G003858
描述	protein PLASTID TRANSCRIPTIONALLY ACTIVE 7
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	57672997 - 57674764 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014730`
GeneID	`131014730`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014730`
原始查询	`SmilChr03G003858`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein PLASTID TRANSCRIPTIONALLY ACTIVE 7
产物	protein PLASTID TRANSCRIPTIONALLY ACTIVE 7
Arabidopsis	`AT5G24314` (PTAC7) plastid transcriptionally active7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832500] identity=55.3; qcov=0.953; evalue=1.43e-52; confidence=high
Rice	`Os01g0705300` (P0692C11.5-1) - identity=55.5; qcov=0.651; evalue=3.92e-38; confidence=medium
GO	GO:0000427 (plastid-encoded plastid RNA polymerase complex); GO:0042793 (plastid transcription)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014730

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057798794.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057798794.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798794.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798794.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798794.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:57673049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr3:57673323`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B117,C7
`Chr3:57674297`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr3:57674354`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942811.1
AGTGAAATTAGATAAGCTTGATTTGCAATGGCGCTGCTTACTGCAACTTTCAGCAGCACTTCATTTTCCCACTCCTTCCCTGTAAATAGAATCGAGTTAAAACCGGAGAACAAATGGCGGCTATGTTTTGCTATGAAGTCACAGGTTAGAATTGTAGATAGTTCGAGCTCACGAAATTCAGGGCGCAGTCATAGGCAAGTGTGGAGGCGGAGAAAATTGGTGAAAAAAGATAAGGTCAGGATAGACAGAGTTCCGTTTCT...

XM_057942812.1
AGTGAAATTAGATAAGCTTGATTTGCAATGGCGCTGCTTACTGCAACTTTCAGCAGCACTTCATTTTCCCACTCCTTCCCTGTAAATAGAATCGAGTTAAAACCGGAGAACAAATGGCGGCTATGTTTTGCTATGAAGTCACAGGATAGTTCGAGCTCACGAAATTCAGGGCGCAGTCATAGGCAAGTGTGGAGGCGGAGAAAATTGGTGAAAAAAGATAAGGTCAGGATAGACAGAGTTCCGTTTCTTGAGGAACAGGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131014730
ATGGCGCTGCTTACTGCAACTTTCAGCAGCACTTCATTTTCCCACTCCTTCCCTGTAAATAGAATCGAGTTAAAACCGGAGAACAAATGGCGGCTATGTTTTGCTATGAAGTCACAGGTTAGAATTGTAGATAGTTCGAGCTCACGAAATTCAGGGCGCAGTCATAGGCAAGTGTGGAGGCGGAGAAAATTGGTGAAAAAAGATAAGGTCAGGATAGACAGAGTTCCGTTTCTTGAGGAACAGGTGAGGAAGATAAGGGA...

LOC131014730
ATGGCGCTGCTTACTGCAACTTTCAGCAGCACTTCATTTTCCCACTCCTTCCCTGTAAATAGAATCGAGTTAAAACCGGAGAACAAATGGCGGCTATGTTTTGCTATGAAGTCACAGGATAGTTCGAGCTCACGAAATTCAGGGCGCAGTCATAGGCAAGTGTGGAGGCGGAGAAAATTGGTGAAAAAAGATAAGGTCAGGATAGACAGAGTTCCGTTTCTTGAGGAACAGGTGAGGAAGATAAGGGAGTCGGGTGAGCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057798794.1
MALLTATFSSTSFSHSFPVNRIELKPENKWRLCFAMKSQVRIVDSSSSRNSGRSHRQVWRRRKLVKKDKVRIDRVPFLEEQVRKIRESGELLTMDIERLLLSEDNRFDFVNEVAAEAKQYVENNRDEYGAKKAILHVISNRMNDSGVYRPEAYKEDDPFKPGPGFLRQELYDK

XP_057798795.1
MALLTATFSSTSFSHSFPVNRIELKPENKWRLCFAMKSQDSSSSRNSGRSHRQVWRRRKLVKKDKVRIDRVPFLEEQVRKIRESGELLTMDIERLLLSEDNRFDFVNEVAAEAKQYVENNRDEYGAKKAILHVISNRMNDSGVYRPEAYKEDDPFKPGPGFLRQELYDK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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