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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003866`

染色体: Chr03 坐标: 57763343-57766495 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003866`
名称	SmilChr03G003866
描述	histone-lysine N-methyltransferase ATXR6
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	57763343 - 57766495 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014716`
GeneID	`131014716`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014716`
原始查询	`SmilChr03G003866`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone-lysine N-methyltransferase ATXR6
产物	histone-lysine N-methyltransferase ATXR6
Arabidopsis	`AT5G24330` (ATXR6) TRITHORAX-RELATED PROTEIN 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832503] identity=65.2; qcov=1.01; evalue=1.91e-163; confidence=high
Rice	`Os01g0965500` (OsSET6) - identity=61.3; qcov=0.903; evalue=3.31e-142; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	smil00310 (Lysine degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00628 (PHD); PF00856 (SET)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014716

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798767.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057798767.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057798767.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798767.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798767.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:57763605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr3:57764058`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr3:57764775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C39,C69
`Chr3:57764940`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr3:57765098`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B36,C16
`Chr3:57766104`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B55,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798767.1

352 aa

176

352

PHD

SET

PF00628 PHD 40-84 aa PF00856 SET 229-340 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798767.1`	Pfam	`PF00628`	PHD	Domain	40	84	2.3e-11	44.2	PHD-finger
`XP_057798767.1`	Pfam	`PF00856`	SET	Family	229	340	7.5e-09	36.7	SET domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942784.1
AAAATCTGAAGTAATGCCGCGAAACTCCGATTTACCCGCGCACATAGCTTTGCCCTCTCTTTCTCTCTCCCTCTAAAATTTCCCATTTCTTAAGCCAATGTGAAAACCCTCATTCTCCATTTCACTCTCCTTCTCTCACACCCACCATTACATTCTTCACGCCGCAGGAATGGCGTCGCTCAGGAAGAGAACCCACGCTCCGAAACCAGCTAATCACCCCAAGATTGCTCCCAGAAAAAGATCCAGATCGAAGCAAGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014716
ATGGCGTCGCTCAGGAAGAGAACCCACGCTCCGAAACCAGCTAATCACCCCAAGATTGCTCCCAGAAAAAGATCCAGATCGAAGCAAGAAGAATCGGACGATTACAGCGACACGCGCTGCGTGAAATGCGGGTCGGGTCAATACCCGGCGGAGCTCCTCTTGTGCGATAAATGTGACTCTGGCTTCCACCTCTTCTGCCTCCGACCGGTTCTCGTCGCCGTCCCCAAAGGCCGCTGGTTCTGCCCCTCTTGCTCCGATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798767.1
MASLRKRTHAPKPANHPKIAPRKRSRSKQEESDDYSDTRCVKCGSGQYPAELLLCDKCDSGFHLFCLRPVLVAVPKGRWFCPSCSDQGNPSNLTLVQTKIVDFFRIQRSSQPAEKLSPESKKKRRRTGGLVMSKKRRKLLPFIPTEDPDRTLEQMASLATALNATGTEFSNELTYIPGMAPRSANCATLERDGMQVMSKDDTETLNLCKNMMEQGEWPPLMVVFDPREGFTVEADRCIRDLTIITEYIGDVDFLKNREHD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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